16S rDNA测序分析报告.pdfVIP

1.3数据分析程序信息.4

二、技术方法与流程.5

2.1实验流程.5

2.2信息分析流程.6

三、生物信息分析.7

3.1原始数据原始数据.7

3.2数据处理和统计.9

3.2.1原始数据经过过滤处理.9

3.3OTU聚类分析.11

3.4GREENGENE数据库比对.12

3.5RDP物种分类.12

3.6ALPHA多样性分析.15

3.7β多样性分析.17

3.7.1绘制稀释曲线.17

3.8聚类分析结果.18

四、们.18

1.3数据分析程序信息4

二、技术方法与流程5

2.1实验流程5

2.2信息分析流程6

三、生物信息分析7

3.1原始数据RAWDATA7

3.2数据处理和统计9

3.2.1原始数据经过过滤处理9

3.3OTU聚类分析11

3.4GREENGENE数据库比对12

3.5RDP物种分类12

3.6ALPHA多样性分析15

3.7ADIVERSITY分析17

3.7.1绘制稀释曲线17

3.8聚类分析结果18

四、们18

1.1样品信息

表1.1样品信息表

客户样品名称处理,对照

样品物种细菌

样品接收日期2014‑07‑09

服务类型16Sr

LCS项目编号2014F12C42

引物名称319F,806R

1.2数据库信息

表1.2数据库信息列表

版本/建

使用数据库网页

立日期

rRNA数

Greengene:bin/nph‑index.cgiN/A

据库

rRNA数

RDP(核糖体数据库项目):N/A

据库

库N/AN/A

1.3数据分析程序信息

表1.3数据分析程序列表