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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下关于二代测序(NGS)原理的描述,正确的是?
A.基于链终止法(Sanger测序原理)
B.边合成边测序(通过荧光信号实时读取)
C.依赖连接酶连接寡核苷酸探针(SOLiD技术)
D.通过纳米孔电流变化直接读取碱基(PacBio技术)
答案:B
解析:NGS主流技术(如Illumina)采用边合成边测序原理,通过dNTP连接时释放的荧光信号实时读取碱基;A为Sanger测序原理,C为SOLiD技术原理,D为三代测序(纳米孔)原理,均错误。
根据ACMG变异分类标准,以下哪项属于“致病性(Pathogenic)”的核心证据?
A.群体频率显著高于疾病发病率
B.多个计算工具预测为良性
C.家系共分离分析显示变异与表型共传递(LOD≥3)
D.数据库中记录为“意义未明(VUS)”
答案:C
解析:ACMG致病性证据包括家系共分离(PS1)、功能丧失机制(PVS1)等;A为良性证据(BS1),B为支持良性证据(BP4),D无明确致病性,故C正确。
以下哪个数据库主要用于存储人群基因变异频率数据?
A.ClinVar
B.gnomAD
C.HGMD
D.dbSNP
答案:B
解析:gnomAD(基因组聚集数据库)专注于健康人群变异频率统计;A(ClinVar)存储临床意义注释,C(HGMD)聚焦致病突变,D(dbSNP)记录所有变异位点(包括良性),故B正确。
基因数据质量控制中,“Q30”指标的含义是?
A.测序错误率≤0.1%的碱基比例
B.测序错误率≤1%的碱基比例
C.比对到参考基因组的reads比例
D.目标区域覆盖深度≥30×的比例
答案:A
解析:Q30表示碱基质量值≥30,对应错误率为10^-3(0.1%);B为Q20(错误率1%),C为比对率,D为覆盖深度指标,故A正确。
连锁不平衡(LD)中,r2值越接近1表示?
A.两个位点独立遗传
B.两个位点的等位基因关联越弱
C.两个位点的单倍型频率偏离预期程度越大
D.群体中位点突变率越高
答案:C
解析:r2是LD的量化指标,范围0-1,越接近1表示两位点的单倍型频率与预期(独立情况下)的偏离程度越大(即关联越强);A、B描述相反,D与LD无关,故C正确。
以下哪种技术更适合检测大段拷贝数变异(CNV)?
A.外显子组测序(WES)
B.全基因组测序(WGS)
C.Sanger测序
D.实时荧光定量PCR(qPCR)
答案:B
解析:WGS通过全基因组覆盖和深度分析,可高效检测CNV;WES因仅覆盖外显子区,CNV检测敏感性较低;Sanger和qPCR适合小片段或定点检测,故B正确。
基因变异注释中,“PolyPhen-2”工具的主要功能是?
A.预测变异对蛋白质功能的影响
B.计算变异在人群中的频率
C.分析变异的保守性
D.验证变异的家系共分离
答案:A
解析:PolyPhen-2(PolymorphismPhenotyping)是蛋白质功能预测工具,通过结构和序列信息评估错义突变的致病性;B为频率数据库功能,C为PhyloP等保守性工具功能,D为家系分析功能,故A正确。
“外显率(Penetrance)”指的是?
A.携带变异的个体中表现出相应表型的比例
B.变异在群体中的发生频率
C.变异导致蛋白质完全丧失功能的概率
D.变异在染色体上的位置保守性
答案:A
解析:外显率定义为携带致病变异的个体实际表现出疾病表型的比例;B为群体频率(MAF),C为功能丧失(LOF)概率,D为保守性,故A正确。
评估变异临床意义时,若某变异在gnomAD中的等位基因频率(MAF)为5%,通常提示?
A.可能为致病变异(需结合其他证据)
B.极可能为良性变异(BS1证据)
C.属于新发突变(denovo)
D.符合孟德尔隐性遗传模式
答案:B
解析:ACMG标准中,若变异在健康人群中的频率显著高于疾病发病率(如MAF1%),可作为良性证据(BS1);A与BS1矛盾,C需家系验证,D与频率无关,故B正确。
以下哪种情况符合常染色体显性遗传(AD)的特征?
A.患者多为隐性纯合子(aa)
B.男女患病概率均等
C.携带者(Aa)通常不表现症状
D.变异需来自父母双方
答案:B
解析:AD遗传中,杂合子(Aa)即可发病,男女概率均等;A为隐性遗传(aa),C为隐性携带者特征,D为隐性遗传(需父母各传一个),故B正确。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)
以下符合HGVS(人类基因组变异协会)命名规则的是?
A.c.123AT(编码区单碱基变异)
B.g.456del(线粒体DNA变异)
C.m.789dup(基因
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