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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种文件格式用于存储带有质量分数的测序原始数据?
A.FASTA
B.FASTQ
C.BAM
D.VCF
答案:B
解析:FASTA格式仅存储序列信息(A错误);FASTQ格式包含序列ID、序列数据、质量分数行(B正确);BAM是SAM的二进制压缩格式,用于存储比对结果(C错误);VCF用于存储基因变异信息(D错误)。
常用于RNA-seq数据比对的工具是?
A.BLAST
B.HISAT2
C.GATK
D.PFAM
答案:B
解析:BLAST用于序列同源性搜索(A错误);HISAT2是专为RNA-seq设计的比对工具(B正确);GATK用于变异检测与校正(C错误);PFAM是蛋白质结构域数据库(D错误)。
以下哪个数据库属于二级生物信息学数据库?
A.GenBank
B.UniProt
C.KEGG
D.SRA
答案:C
解析:GenBank(一级核酸序列数据库)、UniProt(一级蛋白质序列数据库)、SRA(原始测序数据存档库)均为一级数据库(A/B/D错误);KEGG整合了代谢通路、疾病等信息,属于二级数据库(C正确)。
在差异表达分析中,FDR(错误发现率)校正的主要目的是?
A.提高统计检验的功效
B.减少假阳性结果
C.增加差异基因的数量
D.降低测序数据的错误率
答案:B
解析:FDR通过校正多重检验问题,控制假阳性比例(B正确);提高功效需优化实验设计(A错误);增加差异基因数量与校正目的矛盾(C错误);降低测序错误率依赖质控步骤(D错误)。
三代测序技术(如PacBio)的主要特点是?
A.读长较短(300bp)
B.错误率低(1%)
C.无需PCR扩增
D.通量极高(Tb级数据)
答案:C
解析:三代测序读长可达数万bp(A错误);错误率约10-15%(B错误);采用单分子测序,无需PCR扩增(C正确);通量低于二代测序(D错误)。
以下哪种工具用于蛋白质相互作用网络分析?
A.STRING
B.DAVID
C.DESeq2
D.FastQC
答案:A
解析:STRING数据库整合蛋白质互作信息(A正确);DAVID用于功能富集分析(B错误);DESeq2用于差异表达分析(C错误);FastQC用于数据质控(D错误)。
SAM文件中“MAPQ”字段表示?
A.比对位置的染色体编号
B.测序片段的长度
C.比对质量的概率得分
D.序列的GC含量
答案:C
解析:MAPQ(MappingQuality)表示比对位置的可靠性,数值为-10log10(错误比对概率)(C正确);染色体编号由“RNAME”字段记录(A错误);片段长度由“TLEN”字段记录(B错误);GC含量需额外计算(D错误)。
全基因组关联分析(GWAS)的主要目的是?
A.鉴定单基因遗传病的致病基因
B.分析肿瘤中的驱动突变
C.关联遗传变异与复杂性状
D.预测蛋白质三维结构
答案:C
解析:GWAS通过全基因组SNP分型,寻找与复杂疾病/性状关联的遗传标记(C正确);单基因病通常用家系连锁分析(A错误);驱动突变筛选需外显子测序结合功能验证(B错误);蛋白质结构预测依赖AlphaFold等工具(D错误)。
以下哪种数据格式用于存储基因表达矩阵?
A.BED
B.GTF
C.CSV
D.VCF
答案:C
解析:BED用于基因组区间注释(A错误);GTF用于基因结构注释(B错误);CSV(逗号分隔值)是常用的表达矩阵存储格式(C正确);VCF用于变异信息(D错误)。
生信分析中“去接头(AdapterTrimming)”步骤的主要目的是?
A.去除低质量碱基
B.消除测序仪引入的系统误差
C.移除测序接头污染
D.提高序列比对的准确性
答案:C
解析:去接头专门针对测序过程中残留的接头序列污染(C正确);低质量碱基去除由质量剪切(Trimming)完成(A错误);系统误差校正需通过标准化流程(B错误);提高比对准确性依赖多步骤质控(D错误)。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)(每题至少2个正确选项)
以下属于二代测序(NGS)技术特点的有?
A.读长较短(50-300bp)
B.单分子实时测序
C.基于边合成边测序原理
D.错误率主要为随机错误
答案:ACD
解析:二代测序读长较短(A正确);基于桥式PCR扩增和边合成边测序(C正确);错误类型多为随机错误(D正确);单分子实时测序是三代技术特点(B错误)。
常用的RNA-seq数据质量控制工具包括?
A.FastQC
B.MultiQC
C.Trimmomatic
D.BWA
答案:ABC
解析:FastQ
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