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434脑与神经疾病杂志2025年第33卷第7期
论著
转录组学与全基因组关联分析帕金森病
潜在治疗靶点
王子豪夏欢高美蓉王晓蓓杨新玲
【摘要】目的通过对帕金森病(PD)小鼠mRNA进行全基因组测序,探索PD中潜在药物靶点及
治疗药物。方法建立1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶(MPTP)诱导的PD小鼠模型,进行行为学
及免疫组化实验。对PD及对照组小鼠黑质进行转录组测序,结合表达数量性状基因位点(eQTL)数据进
行遗传组学分析。通过RT-qPCR验证基因表达,利用DSigDB预测潜在治疗药物。结果PD组小鼠在
旷场实验中表现出行走距离、平均速度及自由活动时间显著降低,抓力实验显示前肢神经肌肉力量减弱,
免疫组化发现其脑内酪氨酸羟化酶(TH)表达水平显著低于正常组。通过对PD及对照组小鼠脑黑质转录
组测序,筛选出203个差异表达基因(DEGs),其中109个上调,94个下调。GSEA分析揭示自噬、化
学应激和昼夜节律与PD相关。遗传调控分析中筛选出193个与DEGs相关的单核苷酸多态性(SNPs),
Ceptl和Jun基因显著增加PD风险(OR=1.16和1.11),Golml和Mfsd5基因具有保护作用(OR=0.88和
0.90)。RT-qPCR显示,PD小鼠黑质中Golml和Jun基因表达下调。提示尼洛替尼、贯叶连翘素、司来吉兰、
阿扑吗啡和牛磺熊去氧胆酸共5种药物具有治疗潜力。结论通过PD小鼠转录组学及全基因组关联分析,
发现Ceptl和Jun显著增加PD风险,而Golm1和Mfsd5具有保护作用。利用DSigDB预测出5种具有潜力
的治疗药物,包括尼洛替尼、贯叶连翘素、司来吉兰、阿扑吗啡和牛磺熊去氧胆酸。
帕金森病;全基因组测序;遗传组学;药物靶点
【关键词】市
中图分类号:R742.5文献标识码:A文章编号:1006-351X(2025)07-0434-06
Transcriptomicsandgenome-wideassociationanalysispotentialtherapeutictargetsforParkinsonsdisease
WangZihao,XiaHuan,GaoMeirong,WangXiaobei,YangXinling
KeyLaboratoryoftheSecondAffiliatedHospitalofXinjiangMedicalUniversity,Urumqi830000,China
Correspondingauthor:YangXinling,Email:yangxinling2014@163.com
[Abstract]ObjectiveThisstudyaimstoidentifypotentialdrugtargetsandtherapeuticcompoundsin
Parkinsonsdisease(PD)pathogenesisusingwhole-genomemRNAsequencinginaPDmousemodel.MethodsA
PDmousemodelwasinducedusing1-Methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine(MPTP),followedbybehavioral
assessmentsandimmunohistochemicalanalysis.Transcriptomicsequencingwasperformedonthesubstantianigra
ofbothPDandcontrolmice.Genomicanalysisincorporatedexpressionquantitativetraitlocus(eQTL)data,andkey
geneexpressionswereconfirmedbyRT-qPCR.Potential
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