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蒙古羊基因组中EnJSRV的分布特征与生物学意义探究
一、引言
1.1研究背景
蒙古羊作为中国数量最多、分布最广的粗毛绵羊品种,是我国宝贵的畜禽遗传资源之一。其原产于蒙古高原,中心产区位于内蒙古自治区锡林郭勒盟、呼伦贝尔市等地,在东北、华北、西北各地也均有分布。蒙古羊具有生活力强、适于游牧、耐寒、耐旱等特点,在长期的自然选择和人工选育过程中,适应了蒙古草原极端的自然环境,与人类文明协同发展,不仅是畜牧业的重要支柱,更是北疆文化不可或缺的重要符号。2020年5月29日,蒙古羊被列入《国家畜禽遗传资源品种名录》,凸显了其在遗传资源保护中的重要地位。据官方数据显示,2019年蒙古羊的存栏量约为1000万头,占全国牲畜总数的近三分之一,在肉类总产量中,羊肉占主导地位,约占75%,这一数字不仅反映了蒙古羊在畜牧业中的重要经济地位,也显示了其巨大的市场潜力。
内源性绵羊肺腺瘤病毒(EndogenousJaagsiekteSheepRetrovirus,enJSRV)属于内源性逆转录病毒(EndogenousRetrovirus,ERV)。ERV是远古逆转录病毒感染生殖细胞后,永久整合进宿主基因组的遗迹,在哺乳动物基因组中广泛存在,人类基因组中约8%-10%由ERV组成。enJSRV与外源性绵羊肺腺瘤病毒(JaagsiekteSheepRetrovirus,JSRV)相关性很大,在绵羊基因组中已发现最少27个拷贝数。研究enJSRV在蒙古羊基因组中的分布,对于深入理解蒙古羊的基因组构成、遗传进化以及相关疫病的防控具有重要意义。
1.2EnJSRV研究进展
enJSRV属于β逆转录病毒,其基因结构包含gag、pro、pol和env四个主要基因,两端还存在长末端重复序列(LTR)。gag基因编码病毒的衣壳蛋白(CA)、核衣壳蛋白(NC)和基质蛋白(MA),这些蛋白构成病毒粒子双层壳的内壳,与病毒的抗原性密切相关;pro基因编码的蛋白以聚合多肽蛋白前体Gag-pro形式表达,其5’端和3’端分别编码dUTP酶和羧基蛋白酶PR,在病毒粒子的反转录、成熟与包装等生活周期中起关键作用;pol基因主要编码病毒的反转录酶(RT)和整合酶(IN),RT负责把病毒RNA反转录为病毒cDNA,IN负责将前病毒DNA基因组整合至宿主细胞的染色体DNA中;env基因主要编码病毒的囊膜蛋白,蛋白质部分由二条肽链组成,较小的一条链贯穿病毒的囊膜,称为跨膜蛋白(TM),较大的链通过二硫键和氢键与TM相连,称为表面蛋白(SU)。
enJSRV与外源性JSRV关系紧密,外源性JSRV是绵羊肺腺瘤病(OvinePulmonaryAdenocarcinoma,OPA)的病原体,主要临床症状为咳嗽、呼吸困难、虚弱、渐进性消瘦、大量浆液性鼻漏,主要病变为肺泡Ⅱ型上皮细胞和无纤毛细支气管上皮细胞腺泡样肿瘤性增生。虽然enJSRV在正常绵羊基因组中普遍存在,但它在绵羊体内经过数百万年的演化,参与了生殖生理过程,甚至可能帮宿主抵御外源性逆转录病毒的感染。研究发现enJSRV在绵羊生殖道内的表达提示它对机体的可能作用是有益方面大于有害方面,且在绵羊胎盘形成过程中有重要的作用,其囊膜蛋白(Env)能够在绵羊绒毛膜滋养层细胞融合过程中起促进作用。
在组织表达方面,enJSRV在绵羊的多种组织中均有表达。通过原位杂交检测到enJSRVRNAs在与小肠固有层相关的淋巴样细胞和绵羊胎儿胸腺中存在,在肺中也检测到低水平表达。利用TaqMan实时荧光定量PCR技术检测发现,enJSRV在蒙古绵羊妊娠早期的子宫内膜、宫颈、输卵管、阴道上皮组织中均有表达,且子宫内膜组织中enJSRVmRNA的表达与外周血孕酮含量的变化相关。
在系统进化分析上,研究发现enJSRV插入会对绵羊的表型产生影响,而且在绵羊群体中具有高度多态性。通过对不同绵羊品种中enJSRV的序列分析,揭示了其在不同种群中的进化差异和遗传多样性。
1.3研究目的与意义
本研究旨在揭示蒙古羊基因组中EnJSRV的分布规律,明确其在蒙古羊染色体上的具体位置和拷贝数情况。通过对EnJSRV分布的研究,能够进一步了解该病毒在蒙古羊基因组中的进化历程,以及其与宿主基因组的相互作用关系,为病毒进化研究提供新的视角。
从疫病防控角度来看,enJSRV与外源性致病病毒JSRV密切相关,深入了解enJSRV在蒙古羊基因组中的分布,有助于揭示其在抵御外源性病毒感染中的潜在作用机制,为绵羊肺腺瘤病等相关疫病的防控策略制定提供理论依据,从而降低疫病对畜牧业的危害,
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