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口腔颌面外科杂志2024年6月第34卷第3期
JournalofOralandMaxillofacialSurgeryVol.34No.3June,2024··
193
[临床研究]
影响口腔鳞状细胞癌预后潜在靶点的生物信息学分析
邹宪,宋涛
(哈尔滨医科大学附属第一医院口腔科,哈尔滨150001)
[摘要]目的:应用生物信息学技术对口腔鳞状细胞癌(oralsquamouscellcarcinoma,OSCC)基因芯片数据进行差异
表达基因(differentiallyexpressedgenes,DEGs)筛选,进一步预测潜在靶点及预后基因。方法:利用基因表达综合数
据库(geneexpressionomnibus,GEO)下载基因芯片数据集(GSE23558和GSE138206),联合GEO2R工具在线分析
OSCC与正常口腔黏膜组织的DEGs;并对其进行相关通路、蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络及
关键网络节点分析,筛选前25个枢纽基因,通过多个外部数据库对其进行验证。应用Timer网站进一步分析枢纽基
因与免疫细胞浸润及免疫检查点的关系,基于Lasso-Cox算法,构建相关基因的预后风险模型。构建包含预后风险模
型和多个临床病理因素的列线图。结果:分泌磷酸蛋白1(secretedphosphoprotein1,SPP1)、整合素α3(integrinα3,
ITGA3)基因在头颈部鳞状细胞癌(headandnecksquamouscellcarcinoma,HNSCC)中的表达水平与患者的不良预后
P
相关(0.05)。ITGA3被认为是具有未来临床意义的潜在免疫治疗靶点。基于SPP1和ITGA3基因构建的预后模型,
可以有效预测OSCC患者的预后。结论:ITGA3、SPP1可能为OSCC患者的治疗靶点及预后的生物标志物,并为探索
OSCC的分子机制提供了理论依据。
[]
关键词口腔鳞状细胞癌;差异表达基因;靶基因;ITGA3;预后风险模型
[]]
中图分类号R782[文献标志码ADOI:10.12439/kqhm.1005-4979.2024.03.005
BioinformaticsanalysisofpotentialtargetsinfluencingtheprognosisofOSCC
ZOUXian,SONGTao
(DepartmentofStomatology,theFirstAffiliatedHospitalofHarbinMedicalUniversity,
Harbin150001,China)
[Abstract]Objective:Toapplybioinformaticstechnology
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