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核农学报2025，39（3）：0489~0503

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JournalofNuclearAgriculturalSciences

文章编号：1000‐8551（2025）03‐0489‐15

甘蓝型油菜苗期叶绿素含量的全基因组关联分析

邢佳妮张雅怡宋文健苏柯星孙醒醒孙羽佳江一舟赵晓波*

（浙江大学农业与生物技术学院原子核农业科学研究所，农业农村部核农学重点开放实验室/浙江省核农学重点实验室，

浙江杭州310058）

摘要：叶片的叶绿素含量与农作物的光合作用效率和产量潜力紧密相关。为探究影响甘蓝型油菜叶

绿素含量的遗传机理，挖掘与甘蓝型油菜苗期叶绿素含量显著相关的单核苷酸多态性（SNP）位点及候

选基因，本研究对278份来自世界各地的甘蓝型油菜核心种质苗期子叶中叶绿素的含量进行了测定，并

利用rMVP软件的GLM、MLM和FarmCPU三种全基因组关联分析模型对总叶绿素含量、叶绿素a含量、

叶绿素b含量及叶绿素a与叶绿素b含量比值分别进行了全基因组关联分析。研究结果显示：叶绿素a与

叶绿素b含量比值的变异系数最小，为20%，叶绿素b含量的变异系数最大，达到了33%；上述四个叶绿

素含量相关表型分别检测到了2、6、4和37个显著关联的SNP位点，这些SNP位点集中分布在A03、A04、

C03、C05和C07等染色体上。进一步结合基因注释和同源比对共鉴定到70个候选基因，全生育期表达

谱分析发现其中12个候选基因在叶片和角果等绿色组织中特异性高表达。实时荧光定量PCR（qRT-

PCR）结果显示，其中9个候选基因的表达量在高或低叶绿素含量品种中存在差异，暗示这些候选基因

可能参与了叶绿素含量的调控。本研究结果有利于进一步揭示叶绿素含量调控的遗传基础，为甘蓝型

油菜高光效育种提供了理论基础和种质资源。

关键词：叶绿素含量；全基因组关联分析；候选基因；表达分析；甘蓝型油菜

DOI：10.11869/j.issn.1000‐8551.2025.03.0489

［4］

甘蓝型油菜（Brassicanapus）是世界第三大油料作增强，而叶绿素a与叶绿素b含量的比值越低，耐阴

［5］

物，油菜籽油占全球植物油总产量的13%~16%。作物性越强。

产量主要来源于叶片的光合产物，叶绿素含量的高低甘蓝型油菜为异源四倍体，基因组中存在大量拷

直接决定了作物光合效率的快慢和产量高低，选育高贝基因，使得对基因功能的解析变得更加困难。高通

叶绿素含量的甘蓝型油菜是提高产量的重要途径。叶量测序技术的发展和成本的不断降低推动了作物育种

［6］［7］［8］

绿素合成和代谢的遗传机制十分复杂，主基因和多基领域的变革，BrassicaEDB、BnaSNPDB、BnaGVD

因共同决定了油菜叶片叶绿素的含量，其中主基因的和BnIR［9］等甘蓝型油菜多组学数据库的整合和公布

［1］

遗传贡献占主要部分。叶绿素的生物合成受多方面的更加速了油菜基因组学的发展。全基