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基于SIR模型的疫情监测预警系统设计与实现

摘要

每次大规模疫情的爆发都对人类社会的正常发展造成了不可估量的损失。在与传染病的漫长斗争过程中，人们尝试各种方法研究传染病的传播规律以预测其发展趋势，因此传染病动力学模型应运而生，它能够根据群体内各状态人数变化情况、环境因素和人为因素对疫情的发展趋势进行定量预测。模型的数据输入是预测不可或缺的必要条件，因此在提高传染病动力学模型预测精度的同时，还需要为其开发具有疫情数据录入和数据管理功能的疫情监测预警系统。

论文以此为背景，利用经典易感-感染-治愈（Susceptible-Infected-Recovered,SIR）传染病动力学模型对疫情发展趋势进行预测，并考虑人员外出频率对感染率的影响对模型进行了改进，提高其短期预测精度。同时，为了充分发挥模型短期预测能力，论文开发了疫情监测预警系统，为改进后的模型提供了高实时性的病例数据源和数据可视化展示功能。该系统的设计与实现主要针对以下三个问题：第一如何改进SIR传染病预测模型，提高其预测精度；第二如何实现系统的数据录入及展示功能；第三如何提高系统对大规模数据或短时间内爆发式数据的应对能力。

关键词：传染病动力学模型；SIR模型；JavaWeb；

目录

TOC\o1-3\h\z\u第一章 引言 1

第二章 疫情监测系统需求及关键技术分析 2

2.1疫情监测预警系统需求分析 2

2.2关键技术介绍 3

2.2.1SIR传染病动力学模型介绍 3

2.2.1Hadoop大数据平台介绍 3

2.2.3JavaWeb开发框架选型 4

第三章基于SIR模型的疫情监测预警系统的设计与实现 5

3.1疫情监测预警系统总体设计 5

3.1.1疫情监测预警系统结构设计 5

3.1.2疫情监测预警系统操作流程 6

3.2数据持久层的设计与实现 7

3.2.1MySQL数据库设计与实现 7

3.2.2缓存数据库设计与实现 9

3.2.3HDFS分布式文件系统设计与实现 10

3.3数据计算层的设计与实现 11

3.4请求处理层的设计与实现 12

3.5数据可视化层的设计与实现 14

3.6Hadoop服务器集群搭建 16

第四章疫情监测预警系统的部署与测试 19

4.1疫情监测预警系统部署 19

4.2疫情监测预警系统测试 20

4.3测试中遇到的问题及其解决方案 24

第五章结论 25

参考文献 26

致谢 27

引言

数据统计与数据发布是疫情监测预警系统的两大核心功能，在新冠疫情爆发后，数据统计主要通过各级层层上报的方式，数据公开则主要通过新闻报道的方式。这两种方式虽然在很大程度上保证了信息的可靠性及权威性，但对于广大群众而言缺少了随时获取信息的通道以及可视化、易理解的信息形式。因此各种疫情地图不断被开发出来，包括企业组织开发的如丁香医生、百度疫情地图、网易疫情地图等以及研究院校开发的如约翰普林斯顿大学全球新冠疫情地图和兰州大学西部生态安全协同创新中心的《全球COVID-19疫情预报系统》。疫情地图的出现为公众了解疫情发展现状提供了方便快捷的途径与更加直观的可视化角度。不仅如此，兰州大学及约翰普林斯顿大学的系统还提供了一定程度的疫情趋势预测功能。

疫情地图仅仅是数据展示界面，缺少数据收集、趋势预测等功能。为此论文设计了一套基于SIR模型的疫情监测预警系统，该系统除了疫情地图模块外还包括了病例信息录入、病例信息查询、疫情发展预测、病例分布报表等一系列功能。系统的疫情数据收集功能为专家学者对疫情基本情况分析、疫情发展趋势预测等研究提供数据支持；数据公开功能则能够拓宽人民群众对疫情状况的了解渠道，进而提高全民防疫意识，推进防控政策有效落地；疫情发展趋势功能则在一定程度上为管控策略的制定提供了参考建议。针对系统所涉及的用户敏感数据，论文提供了一定程度的信息加密处理，并对病例录入阶段进行后台日志记录，为信息泄露后的追责提供参考依据。

疫情监测系统需求及关键技术分析

2.1疫情监测预警系统需求分析

各种重大传染病在危害人民群众生命财产安全的同时还会对社会经济造成剧烈冲击并一定程度上引发社会恐慌，对社会各个方面造成严重危害。此次新冠疫情的爆发更是对公共卫生系统提出了新挑战，为了提高应对突发传染病疫情能力，完善信息化疫情防控机制，保障人民群众生命及财产安全，建立一套敏感、高效、公开的疫情监测预警系统是十分必要和迫切的。疫情监测预警系统不仅需要及时收集已发病例的信息，更要将疫情发展状况公之于众，提高全民防疫、抗疫意识，为满