基于TMT标记定量技术的不同壳色虾夷扇贝的蛋白质组学分析.pdfVIP

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第40卷第1期大连海洋大学学报Vol.40No.1

2025年2月JOURNALOFDALIANOCEANUNIVERSITYFeb.2025

DOI:10.16535/j.cnki.dlhyxb.2024 ̄095文章编号:2095 ̄1388(2025)01 ̄0095 ̄12

基于TMT标记定量技术的不同壳色虾夷扇贝

的蛋白质组学分析

唐安琪ꎬ原畅梓ꎬ杭雲娜ꎬ毛俊霞ꎬ王许波ꎬ田莹ꎬ

郝振林ꎬ丁君ꎬ常亚青∗

(大连海洋大学水产与生命学院农业农村部北方海水增养殖重点实验室ꎬ辽宁大连116023)

摘要:为探究虾夷扇贝(Patinopectenyessoensis)壳色形成的分子机制ꎬ采用TMT(tandemmasstagsꎬ串联

质量标签)标记定量技术ꎬ对两种不同壳色虾夷扇贝(褐色和白色)外套膜组织进行了蛋白质组学分析ꎮ

结果表明:在虾夷扇贝外套膜中鉴定获得可信蛋白5177个ꎬ其中在两种壳色扇贝间显著差异表达蛋白

(differentiallyexpressedproteinsꎬDEPs)343个ꎬ其中在白色个体中上调和下调表达分别为187、156个ꎻ

GO和KEGG功能富集分析显示ꎬ黑色素合成、钙离子调控及神经调控相关功能和通路在DEPs中显著富

集ꎬ推测它们在虾夷扇贝壳色的形成及调控中发挥重要作用ꎻ免疫相关功能和分子通路也显著富集ꎬ表明

两种壳色扇贝间很可能存在免疫差异ꎮ本研究为虾夷扇贝壳色形成机制研究提供了更多依据ꎬ为以壳色为

目的性状的贝类抗病良种培育提供了科学参考ꎮ

关键词:虾夷扇贝ꎻ壳色ꎻ蛋白质组学ꎻ黑色素合成ꎻ钙离子调控

中图分类号:S9174文献标志码:A

贝类作为一种非常古老的类群ꎬ在进化过程以串联质量标签(TMTꎬtandemmasstagsꎬ串联质

中ꎬ颜色演变得丰富多彩ꎮ贝类壳色与贝类的警戒量标签)和同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)

[1]

伪装、免疫防御及环境适应等具有密切的关系ꎮ技术为代表的定量蛋白质组学技术ꎬ具有通量高、

此外ꎬ贝类壳色作为一个可遗传性状ꎬ还与贝类的重复性好、准确性高、数据丰富和自动化程度化高

生长、存活和抗逆等表型性状有关ꎬ具有重要的育等优点ꎬ在蛋白质组学领域得到广泛运用ꎮ目前ꎬ

[2]

种价值ꎮ因此ꎬ开展贝类壳色形成机制研究ꎬ蛋白质组学技术在贝类中已得到了一定应用ꎬ涉及

将有助于更好地理解贝类壳色变异的生态及进化意贝类的生长、发育、免疫、神经调控和环境适应

义ꎬ并为壳色性状的遗传育种研究提供借鉴ꎮ等[10 ̄13]ꎬ但在贝类壳色形成机制研究中应用还相

随着高通量测序技术的发展ꎬ基于组学技术的对较少ꎬ限制了对贝类壳色形成分子机制的深入理

壳色形成分子机制研究已在多种贝类中开展ꎬ尤其解ꎮ

在转录组层面开展了大量研究ꎬ鉴定获得了许多与虾夷扇贝(Patinopectenyessoensis)是中国北

[3 ̄5]

贝类壳色形成相关的候选基因或分子通路ꎮ近

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