水稻籽粒抗性淀粉含量全基因组关联分析.pdfVIP

植物遗传资源学报2025，26（8）：1634-1643

JournalofPlantGeneticResourcesDOI：10.13430/ki.jpgr.20241123002

水稻籽粒抗性淀粉含量全基因组关联分析

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姚鑫杰，张风琴，张哲，许冰晗，王敏，胡宁艳，邓子豪，别思源，李培富

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（宁夏大学农学院，银川750021；新疆农业科学院植物保护研究所，乌鲁木齐830091）

摘要：挖掘水稻籽粒抗性淀粉含量相关QTL位点及候选基因，有助于解析水稻籽粒抗性淀粉形成的遗传机制，为培育高

抗性淀粉含量水稻品种提供帮助。利用139份水稻种质资源作为研究材料，于2021-2023连续3年种植并测定籽粒抗性淀粉

含量，结合255501个高质量SNPs标记，通过FarmCPU模型进行全基因组关联分析，共检测到16个与水稻籽粒抗性淀粉含量

显著关联的QTL位点，其中qRS-8-8在4种环境中被重复检测到，该位点表型变异率为33.99%；qRS-11-1在2种环境重复检测

到，该位点表型变异率为14.06%。通过基因功能注释、差异基因表达量和单倍型分析在重复检测到的QTL区间内进一步筛选

出2个与籽粒抗性淀粉含量相关的候选基因，其中LOC_Os08g28670编码Betv1-like特殊结构域蛋白，该结构域蛋白在水稻中

的功能鲜有报道；LOC_Os11g44950编码糖苷水解酶家族蛋白，该家族成员在植物体内参与糖类代谢、生长发育和抵抗逆境等

生理活动。本研究结果为深入解析水稻籽粒抗性淀粉形成的遗传机制提供理论参考，为水稻品质遗传改良提供帮助。

关键词：水稻；籽粒；抗性淀粉；全基因组关联分析；候选基因

Genome-WideAssociationStudyforResistantStarchContentinRice

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YAOXinjie，ZHANGFengqin，ZHANGZhe，XUBinghan，WANGMin，

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HUNingyan，DENGZihao，BIESiyuan，LIPeifu

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（CollegeofAgriculture，NingxiaUniversity，Yinchuan750021；InstituteofPlantProtection，

XinjiangAcademyofAgriculturalSciences，Urumqi830091）

Abstract：Identificationofquantitativetraitloci（QTLs）andcandidategenesrelatedtoresistantstarch

（RS）inricegrainsiscrucialforelucidatingthegeneticbasisofRSaccumula