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校园竞赛bi备手册题目类型与答题技巧解析

一、选择题（每题2分，共10题）

说明：本题型考察基础知识、实验原理及常用工具的应用，侧重于生物医药、农业生物信息学等领域。

1.基因表达谱分析中，哪个工具常用于识别差异表达基因（DEG）？

A.ClustalW

B.DESeq2

C.BLAST

D.Primer3

2.在序列比对中，Smith-Waterman算法与Needleman-Wunsch算法的主要区别是什么？

A.前者局部比对，后者全局比对

B.前者适用于短序列，后者适用于长序列

C.前者不考虑罚分，后者考虑罚分

D.前者时间复杂度低，后者时间复杂度高

3.RNA-Seq数据分析中，哪个步骤用于校正测序深度差异？

A.参考基因组组装

B.TPM标准化

C.k-mer计数

D.序列聚类

4.在系统发育树构建中，邻接法（Neighbor-Joining）主要基于什么距离度量？

A.Jukes-Cantor距离

B.Kimura距离

C.UPGMA（平均分组法）距离

D.Kullback-Leibler散度

5.蛋白质结构预测中，AlphaFold2主要采用哪种方法？

A.蒸汽船折叠（Steamboat）

B.RaptorX

C.Rosetta

D.ModBase

6.在宏基因组分析中，哪个数据库常用于物种注释？

A.NCBIGenBank

B.Pfam

C.KEGG

D.UniProt

7.CRISPR-Cas9基因编辑中，gRNA的设计关键是什么？

A.高GC含量

B.与PAM序列的互补性

C.重复序列的长度

D.mRNA稳定性

8.在生物信息学中，批次效应通常指什么问题？

A.软件版本差异

B.不同实验组间技术噪音

C.参考基因组差异

D.遗传背景不一致

9.nào在RNA结构预测中，Mfold主要用于预测哪种结构？

A.蛋白质二级结构

B.核酸二级结构（RNA/DNA）

C.三级结构

D.四级结构

10.在基因组浏览器中，UCSCGenomeBrowser的主要优势是什么？

A.仅支持人类基因组

B.提供丰富的注释数据（基因、变异、调控元件）

C.仅支持本地数据下载

D.不支持变异注释

二、填空题（每空1分，共5题，每题3空）

说明：本题型考察核心概念、工具名称及实验流程，侧重于基因组学、转录组学基础。

1.在BLAST搜索中，_________参数用于控制比对阈值，_________参数用于调整相似度得分矩阵，_________参数用于限制查询序列长度。

（答案：E-value,Matrixscoring,Wordsize）

2.RNA-Seq数据处理流程包括：_________（原始数据清洗）、_________（读长定量）和_________（差异表达分析）。

（答案：质量控制，定量，统计分析）

3.蛋白质二级结构预测中，_________算法基于动态规划，_________工具使用NUPACK软件，_________数据库提供已知结构模板。

（答案：ViennaRNA，Mfold，PDB）

4.CRISPR-Cas9系统中，_________负责识别目标序列，_________切割DNA，_________（如gRNA）提供靶向特异性。

（答案：Cas9蛋白，Cas9蛋白，向导RNA）

5.基因组组装中，_________算法适用于短读长数据，_________数据库提供非冗余基因组参考，_________工具用于纠正组装错误。

（答案：SPAdes，RefSeq，Pilon）

三、简答题（每题5分，共5题）

说明：本题型考察实验设计、工具原理及结果解读，侧重于农业生物信息学、疾病研究。

1.简述RNA-Seq数据分析中，如何检测可重复的DEG？

（答案：①通过统计学方法筛选（如FDR0.05，FoldChange2）；②结合样本重复实验进行Venn图分析；③使用火山图可视化结果；④验证实验如qPCR确认关键基因。）

2.解释什么是“假阳性”和“假阴性”在序列比对中的含义，如何减少？

（答案：假阳性指错误匹配（如同源而非直系亲属）；假阴性指未检测到真实匹配。减少方法：①提高BLAST参数（如增加E-value阈值）；②使用多序列比对减少模糊匹配；③结合本地数据库搜索。）

3.在宏基因组分析中，为什么需要使用OTU聚类？

（答案：①将序列聚类成操作分类单元（OTU）以代表物种；②减少序列数量，便于统计分析；③标准化不同样本的微生物丰度；④便于物种注释。）

4.比较系统发育树构建中的最大似然法（ML）与贝叶斯法（Bayesian）的优