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382024,Vol.45,No.13食品科学※基础研究
基于氨基酸描述符对血管紧张素转化酶抑制
五肽定量构效关系分析
1,221,21,21,21,231,2,*
郭星晨,李玉豪,马金璞,张钰璇,李华鑫,杨具田,樊佩如,高丹丹
1.-730030
(西北民族大学生物医学研究中心,中国马来西亚国家联合实验室,甘肃兰州;
2.7301243.610207
西北民族大学生命科学与工程学院,甘肃兰州;四川大学化学学院,四川成都)
摘 要:本研究收集近些年报道的血管紧张素转化酶(angiotensinconvertingenzyme,ACE)抑制五肽的氨基酸
序列及抑制活性(半抑制浓度(halfmaximalinhibitoryconcentration,IC50)),建立ACE抑制五肽肽库,并将其
氨基酸残基用Z-scales、VHSE和SVHEHS氨基酸描述符分别进行表述,以氨基酸残基的疏水性、立体性以及电性
参数作为自变量,ACE抑制五肽的lgIC50作为因变量,利用Matlab软件用偏最小二乘法建立ACE抑制肽定量构效
quantitativestructure-activityrelationshipQSARZ-scalesACE
关系(,)模型,结果发现基于描述符构建的抑制五肽
QSAR模型R2为0.6411,Q2为0.5369,模型预测五肽Gln-Arg-Pro-Asn-Met具有较高的ACE抑制活性,预测IC50为
///
0.0517μmolL,实测IC50为(0.0400±0.0083)μmolL,预测值与实测值误差为0.0117μmolL;基于VHSE描述
符构建的QSAR模型R2为0.7636,Q2为0.5081,模型预测五肽Leu-Arg-Ala-Phe-Gln具有较高的ACE抑制活性,预
IC///
测50为0.0438μmolL,实测值为(0.0273±0.0053)μmolL,误差为0.0165μmolL;基于SVHEHS描述符构建
QSARR22/
的模型0.8405Q0.4005μmolLTyr-Phe-Pro-Phe-GlnACE
为,为,模型预测五肽具有较高的抑制活性,预测
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