基于全基因组SNP对苏姜猪选择信号分析.pdfVIP

地方猪种

INDIGENOUSBREEDS

基于全基因组SNP对苏姜猪选择信号

分析

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张伟刘凯瑞孙雯婕高正杰范林涛徐雨馨刘勇志倪黎纲吴嘉韵乔洋洋徐盼

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1.江苏农牧科技职业学院动物科技学院江苏泰州2253002.江苏姜曲海猪种业有限公司江苏泰州225300

（，；，）

江苏省地方猪具有繁殖力高的遗传结构本研究利用全基因组2SNP检出率≥90%3最

、。）；）

肉质优异耐粗饲适应性强性单核苷酸多态性SingleNucleotide小等位基因频率MinorAllele

、、、（（

情温驯性成熟早等优点但也有PolymorphismsSNP芯片数据Frequency，MAF）≥0.01；

、，，），

生长速度慢瘦肉率低的缺点欧以姜曲海猪枫泾猪和杜洛克猪为4哈代温伯格平衡Hardy-Weinberg

、。、）（

洲现代品种猪如大白猪长白猪和参考群基于分析方法检测苏EquilibriumHWE≥10-6

、，F，）；

ST

杜洛克猪瘦肉率高生长速度快姜猪基因组上的选择信号筛选苏5）剔除性染色体。

、、，

饲料转化率高高效利用地方猪和姜猪种质特性相关候选基因为苏1.3系统进化树分析

。，

引入品种猪的优质遗传资源杂交生姜猪品种改良提供重要参考。基于过滤后的全基因组SNP使

产出肉质优生长快繁殖力好用PLINK软件计算试验动物中所有

、、、1材料与方法

瘦肉率高的新品种是保障国家粮食1.1试验动物成对组合之间的遗传距离D计

（），

安全的重要途径以姜曲海猪枫试验动物为来自江苏姜曲海猪算公式为D=1-D