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世界热带农业信息2025年第11期

马铃薯Trihelix基因家族全基因组鉴定与表达分析

马铃薯是继玉米、水稻、小麦后的第四大粮高温）、植物激素（ABA、IAA、GA3）和植物生长

[1]

食作物。然而，其生产受到非生物胁迫的限调节剂（BAP、BABA、BTH）下的基因表达数

制，逆境胁迫严重影响马铃薯的产量和质量。据。利用TBTool工具作热图分析。

Trihelix转录因子是一种对光响应的蛋白，在很

多植物应对逆境胁迫信号转导过程中发挥重要2结果与分析

[2]2.1马铃薯Trihelix家族成员鉴定

作用。目前，从全基因组水平对马铃薯Trihe‐

lix基因家族的鉴定和抗逆功能研究尚未见相根据保守结构域搜索，从马铃薯基因组中

关报道。本文鉴定了马铃薯体内的Trihelix基鉴定出39个Trihelix蛋白，由28个基因编码。

因家族成员，分析了基因结构及进化关系，并利根据基因在染色体上的位置，将其分别命名为

用转录组数据对Trihelix家族基因的组织表达StTrihelix1-28。其蛋白名，基因名及在染色体

和激素及非生物胁迫处理后的表达模式进行分上的位置等相关信息整理如表1。

析，为进一步研究马铃薯Trihelix基因家族的生表1马铃薯Trihelix家族蛋白及基因基本信息

物学功能提供了理论依据。蛋白质命名基因命名染色体基因位置

StTrihelix1StTrihelix1chr01

1材料与方法StTrihelix2.1StTrihelix2chr01

1.1马铃薯Trihelix家族成员的鉴定、定位及系StTrihelix2.2StTrihelix2chr01

统进化树构建

StTrihelix3.1StTrihelix3chr01

从马铃薯基因组数据库SpudDB(http://

StTrihelix3.2StTrihelix3chr01

spuddb.uga.edu/)中下载马铃薯的全基因序列。

StTrihelix4StTrihelix4chr01

利用下载的文件，找到基因号、基因在染色体上

的位置，使用mapchart作图。从PlantTFDBStTrihelix5StTrihelix5chr01

(http://planttfdb./)数据库下载马铃薯StTrihelix6StTrihelix6chr01

和拟南芥蛋白质序列。用MEGA软件多序列StTrihelix7.1StTrihelix7chr02

比对。然后采用临近建树法构建系统进化树。StTrihelix7.2StTrihelix7chr02

1.2基因家族蛋白保守结构域分析和基因结构StTrihelix8StTrihelix8chr02

分析St