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《不同生物来源天然产物的化学信息学分析》姓名:班级:学号:

目录CONTENT论桔梗成分及抗癌研究海洋天然产物的类型及其活性总结与展望

01绪论

绪论来自不同生物材料的天然产物的化学信息学是一门利用信息技术解决化学问题的研究。上世纪中后期,计算机技术的发展日新月异,逐渐应用于人类生产生活的方方面面。同时,各个生物领域天然产物的化学信息学也得到了突破,多年来收集了不同生物材料的天然产物。因此,开始建立药物样本、光谱数据库等一批大型化学数据库。此后,致力于解决化学问题的计算机技术和信息系统悄然渗透到化学的许多方面。

02桔梗成分及抗癌研究

(一)研究路线本论文的数据来自于微生物天然产物数据库(NaturalProductsAtlas,NPAtlas)。利用多种化学信息学的方法,对不同微生物来源的天然产物进行基于结构的对比和分析。主要研究路线如下:1)对获取的天然产物的结构进行标准化预处理;2)根据物种来源信息对天然产物进行分类;3)计算天然产物的物理化学性质,分析理化性质差异;4)对天然产物结构按不同标准进行拆分,生成不同的片段,分析片段的差异;5)计算天然产物的类药性,对比类药性差异。(二)研究目的及意义为了实现德育与智育的统一,教学文本还应辅以适合文本的情感介绍,模拟真实情境,营造氛围,让学生有身临其境的感觉,让学生在创造的情境和浓厚的氛围中投入学习,让学生获得更真实、更深刻的体验。

(二)研究目的及意义它的主题通常包括创建和发现来自不同生物来源的天然产品的化学信息;不同类型生物制品化学数据的导入、存储和管理;对不同生物制品的化学数据进行加工处理。以及产品化学信息的深度。其中,从不同的生物材料中产生和获取天然产物的化学信息主要是通过实验或计算机研究。随着化学的发展,科学信息的价值大大增加。。深入研究来自不同生物材料的天然产物的化学信息,往往涉及化学知识和计算机模拟。分子设计可以通过计算机实验来完成,如:微观分子工程设计与化学模拟、材料结构与功能的关系及其理论设计与操作模拟、生物活性分子与药物分子的相互作用、医学等。设计、固体表面结构、固体表面轨道五相定律、表面吸附与催化机理研究,以及分子水平以上聚集体结构及其结构与性质的模拟等。这些现在是重要的研究项目,也是未来研究的重要领域。

03海洋天然产物的类型及其活性

(一)天然产物的获取在涵盖所有发表的主要科学文献中的微生物来源的天然产物。这包括细菌、真菌和蓝藻化合物,但不包括来自植物、无脊椎动物或其他高等生物的化合物,除非这些化合物也已从微生物来源明确识别。其中包括来自地衣、蘑菇和其他高等真菌的化合物,但海洋大型藻类和硅藻的化合物不包括在内。(二)天然产物的分类对经过标准化预处理后得到的化合物信息进行整理。数据库提供了天然产物的物种来源信息,根据来源微生物具体的名称,将化合物划分为细菌和真菌两大来源。完成分类后,对天然产物在细菌和真菌来源中的分布频数进行统计。来源于细菌的天然产物共10212个,来源于真菌的天然产物共16912个。

04总结与展望

总结与展望本论文从生物来源(动物、植物和微生物)的角度出发,对DNP数据库中的天然产物进行了物种来源与化合物类型之间关系的研究,重新定义了糖基单元结构并对天然产物进行了去糖基化处理与糖基性质分析,计算了多种理化性质和分子片段,对不同物种来源的天然产物进行了结构骨架的对比分析并进行可视化展示。不同生物来源天然产物的化学信息学分析35分析不仅完善了对天然产物的化学信息学研究,也加深了人类在整体层面上对天然产物的认识,同时彰显了化学信息学方法在解决天然产物相关问题中的独特价值。在药物研发的过程中,天然产物由于其独特新颖的化学结构与广泛的生物活性。一直是新药发现的重要源泉。

总结与展望相较于以往的天然产物分析,本论文的研究具有一定的优势,一方面是选择了比较新颖的角度,即从生物来源的角度出发,并且具体到了更低的物种分类级别,对天然产物的化学空间和结构特征进行了探索,完善了这一方面的研究。另一方面,本论文设计了一种新的糖基单元结构定义对天然产物进行去糖基化,这样做减少了糖或类糖结构片段给研究带来的复杂性。但是本研究也存在一定的局限性,首先是实验数据的不完整,虽然DNP是目前最大的综合型数据库之一,但是由于天然产物信息在收集过程中存在困难,如:从极端环境发现新的化合物、确定物种来源等,这些都导致天然产物的结构及生物来源等信息不够完整。其次是目前并没有一个可用的糖数据库或者准确的糖的定义可以涵盖全部类型的糖基单元结构,所以在糖基单元结构的定义上我们采用了更加保守、严谨的方式。最后,仅从动物、植物和微生物的角度进行分类研究也可能不是很妥当,除了物种起源,生存环境也是影响天

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