图神经网络在多FPGA协同架构中的中间表示优化与流水线并行度提升研究.pdfVIP

图神经网络在多FPGA协同架构中的中间表示优化与流水线并行度提升研究1

图神经网络在多FPGA协同架构中的中间表示优化与流水

线并行度提升研究

1.研究背景与意义

1.1图神经网络的应用场景

图神经网络（GNN）作为一种强大的图数据处理工具，近年来在众多领域展现出了

巨大的应用潜力。在社交网络分析中，GNN能够通过对用户关系图的建模，实现精准

的用户推荐和社区发现。例如，在Facebook等社交平台上，利用GNN可以分析用户

之间的复杂关系，推荐与用户兴趣高度相关的其他用户，其推荐准确率相比传统方法提

高了约30%。在生物信息学领域，GNN被用于蛋白质相互作用网络的预测，通过对蛋

白质结构和相互作用图的建模，能够更准确地预测蛋白质的功能和相互作用，对于新药

研发具有重要意义，能够将药物靶点发现的时间缩短数月。在交通流量预测方面，GNN

可以将城市交通网络建模为图，通过分析交通流量数据，预测未来交通状况，帮助交通

管理部门优化交通信号控制，提高城市交通效率，减少拥堵时间约20%。这些应用场景

表明，GNN在处理具有复杂关系的数据时具有独特的优势，能够为各行业带来显著的

效益提升。

1.2多FPGA协同架构的优势

多现场可编程门阵列（FPGA）协同架构为图神经网络的高效计算提供了新的可能

性。FPGA具有高度的并行性和可重构性，能够针对特定的计算任务进行优化配置。在

多FPGA协同架构中，多个FPGA可以并行处理图神经网络的不同部分，显著提高计

算效率。例如，在处理大规模图数据时，单个FPGA的计算能力可能受限，但通过多

FPGA协同，可以将图数据划分成多个子图，分配到不同的FPGA上并行处理，计算

速度相比单FPGA架构提高了数倍。此外，FPGA的可重构性允许根据图神经网络的

不同阶段和需求动态调整硬件资源分配，实现资源的高效利用。在图神经网络的训练

阶段，需要大量的矩阵运算和数据传输，多FPGA协同架构可以通过优化数据传输路

径和计算任务分配，减少数据传输延迟和计算资源浪费，提高整体计算性能。同时，多

FPGA协同架构还具有良好的扩展性，可以根据计算任务的规模和复杂度灵活增加或

减少FPGA的数量，适应不同场景下的计算需求，为图神经网络的广泛应用提供了强

大的硬件支持。

2.图神经网络基础2

2.图神经网络基础

2.1图神经网络的基本原理

图神经网络（GNN）是一种基于图结构数据的深度学习模型，旨在通过学习图中节

点的表示来捕捉节点间的复杂关系。其基本原理是通过聚合邻居节点的信息来更新当

前节点的特征表示，从而实现对图结构数据的建模和分析。

•消息传递机制：GNN的核心是消息传递机制。每个节点会收集其邻居节点的信

息，并将其与自身的特征进行聚合，生成新的特征表示。这一过程可以用公式表

示为

(l+1)∑(l)



hi=σeijhj

j∈N(i)

，其中h(l)表示节点i在第l层的特征，N(i)是节点i的邻居集合，eij是节点i

i

和j之间的边的权重，σ是激活函数。通过多层的消息传递，节点能够逐渐捕获

到更广泛的邻居信息，从而生成更具代表性的特征表示。

•图卷积操作：图卷积是GNN中常用的计算方式之一。它通过定义图上的卷积操

作来提取节点的局部特征。与传统的图像卷积不同，图卷积需要考虑图的拓扑结

构。常见的图卷积操作包括谱图卷积和空间图卷积。谱图卷积基于图的拉普拉斯

矩阵的特征分解，通过在频域上进行卷积操作来更新节点特征。空间图卷积