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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种技术是二代测序(NGS)的核心原理?
A.链终止法(Sanger测序)
B.边合成边测序(SequencingbySynthesis)
C.纳米孔单分子测序
D.原位杂交测序
答案:B
解析:二代测序(NGS)的核心原理是边合成边测序,通过桥式扩增形成DNA簇后,利用荧光标记的脱氧核苷酸在合成过程中读取序列(如Illumina平台)。A是一代测序技术;C是三代测序(如OxfordNanopore);D是原位测序技术,不属于NGS主流原理。
根据ACMG变异分类标准,以下哪项属于“致病性变异(Pathogenic)”的关键证据?
A.变异在病例中的频率显著高于对照人群
B.变异为同义突变且无功能预测工具支持
C.家系中变异与表型不共分离
D.变异在gnomAD数据库中的等位基因频率>1%
答案:A
解析:ACMG标准中,致病性变异的关键证据包括“病例中变异频率显著高于对照”(PM2/PS4)。B为同义突变通常归为意义未明(VUS);C为排除致病性的证据(BS4);D为高频变异提示良性(BA1/BS1)。
以下哪个数据库主要用于存储人类孟德尔遗传病的基因-表型关联信息?
A.gnomAD
B.dbSNP
C.OMIM
D.COSMIC
答案:C
解析:OMIM(在线人类孟德尔遗传)专注于单基因遗传病的基因-表型关联;A(gnomAD)是群体变异频率数据库;B(dbSNP)是全物种SNP数据库;D(COSMIC)是肿瘤体细胞变异数据库。
基因数据质量控制中,“Q30”指标指的是:
A.测序读长中质量值≥30的碱基比例
B.比对到参考基因组的reads比例
C.目标区域覆盖深度≥30×的比例
D.变异检测中支持变异的reads数≥30
答案:A
解析:Q30表示测序碱基质量值≥30的比例(质量值Q=-10log??错误率,Q30对应错误率0.1%);B是比对率(MappingRate);C是覆盖度(Coverage);D是变异支持度(AlleleDepth)。
以下哪种工具主要用于基因组变异的功能注释?
A.GATK
B.ANNOVAR
C.BWA
D.Samtools
答案:B
解析:ANNOVAR是经典的变异注释工具,可注释变异的基因组位置、功能影响(如外显子/内含子)、数据库关联(如ClinVar)等;A(GATK)用于变异检测;C(BWA)用于序列比对;D(Samtools)用于SAM/BAM文件操作。
连锁不平衡(LinkageDisequilibrium,LD)主要用于描述:
A.同一基因内不同外显子的突变频率
B.染色体上两个位点的等位基因非随机关联程度
C.家系中致病基因与表型的共分离现象
D.肿瘤中不同驱动基因的协同突变模式
答案:B
解析:LD指染色体上两个位点的等位基因同时出现的频率高于随机组合的概率,常用r2或D’表示;A是基因内部突变分布;C是共分离分析;D是肿瘤共突变分析。
以下关于外显率(Penetrance)的描述,正确的是:
A.外显率是指携带变异个体表现出表型的比例
B.外显率仅适用于显性遗传病
C.外显率100%意味着所有携带者都会发病且症状相同
D.外显率与环境因素无关
答案:A
解析:外显率定义为携带特定变异的个体表现出相应表型的比例(如BRCA1突变携带者终身乳腺癌风险约60%,外显率60%);B错误,隐性遗传病也可能涉及外显率(如不完全外显);C错误,外显率不涉及症状严重程度(表现度);D错误,外显率受环境和遗传背景影响。
拷贝数变异(CNV)检测中,基于测序数据的常用方法是:
A.短读长测序的readdepth分析
B.Sanger测序的峰高比值
C.一代测序的片段长度多态性
D.原位杂交的信号强度
答案:A
解析:NGS中CNV检测主要通过readdepth(测序深度)分析(如CNVnator),通过比较目标区域与全基因组的测序深度差异判断拷贝数;B是Sanger测序检测杂合变异的方法;C是STR分型技术;D是FISH技术。
在群体频率数据库中,通常将“良性变异”的阈值设定为:
A.等位基因频率(MAF)>0.5%
B.MAF<0.1%
C.MAF>5%
D.MAF<1%
答案:C
解析:若变异在一般人群中的MAF>5%(如gnomAD数据库),通常提示为良性多态(ACMG标准BA1);A(0.5%)是部分疾病的筛选阈值;B/D为低频或罕见变异,可能为致病候选。
孟德尔遗传病家系分析中,“拟表型(Phenocopy)”指的是:
A.家系中多个成员携带相同变异但表型不同
B.表型与某遗传病相似但由非遗传
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