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生物化学I(2008年秋季学期,A卷)
任课/拟人:郑利民李国富
1.Lysozymedestroysthecellwallofbacteriabycatalyzingthehydrolysisof1,4-β-linkagesweenN-acetylmuramicacid(NAM)and
N-acetyl-D-glucosamine(NAG)residuesinapeptidoglycan..FigureAshowsthehydrolyticprocessof1,4-β-linkagesweenNAMandNAG,andfigureB
showsthepH-activityprofileoflysozyme.(1)DescribefigureArelatedtothecatalyticmechanismofenzyme;(2)Calculatetheratiooftheenzymemolecu
whichreallyworkatpH5.2toallenzymemolecu,andsaysomethingpossibleforwhyitisnotof100%attheoptimalpH(pH=pKa+lg([A-]/[HA]);
pKaGluAsp0.7
=5.9,pKa=4.5;10≈5;12points).
AB
(1)图1显示溶菌酶水解peptidoglycan中的糖苷键时的酸碱催化和共价催化机理【1分】,其中Glu-35起酸催化和共价催化作用【2分】,Asp-52
起碱催化作用【2分】
(2)分子比例:【方法正确但计算错误得3分,方法和计算均正确得5分】
lg([Asp-]/[HAsp])=pH–pKa=5.2–4.5=0.7,[Asp-]/[HAsp]=5
起碱作用的Asp所占比例:[Asp-]/([HAsp]+[Asp-])=[Asp-]/([Asp-]/5+[Asp-])=5/6
lg([Glu-]/[HGlu])=pH–pKa=5.2–5.9=-0.7,[Glu-]/[HGlu]=1/5
起酸作用的Glu所占比例:[HGlu]/([HGlu]+[Glu-])=[HGlu]/([HGlu]+[HGlu]/5)=5/6
真正能工作的酶分子比例=(5/6)×(5/6)≈69.4%
(3)pH5.2是该酶的最佳pH值,但工作的酶分子比例仅为69.4%而非100%。因为在pH5.2,Asp的侧链羧基不可能全部解离,而同时Glu的侧
链羧基也不可能全部保持不解离状态。实际上,不可能存在某个pH值能让某个酶的酸催化基团和碱催化基团同时达到100%的比例。【2分】
2.AreactionsystemincludessubstanceA,substanceBandanenzyme.Thefigureatright
showstheLineweaver-BurkPlotfortheenzyme.IfsubstanceAactsasasubstrateofthe
enzyme,referringtothefigure,pleasedo:(1)describingthepossibleroleofsubstanceB11
inthereactionsystem;(2)comparingthemagnitudeofthecon
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