环境基因组学：并行计算课件.pptxVIP

一、前言;01;;前言;前言;前言;病例介绍：太湖流域底泥宏基因组项目的算力困境;病例介绍：太湖流域底泥宏基因组项目的算力困境;病例介绍：太湖流域底泥宏基因组项目的算力困境;护理评估：并行计算需求的“全身体检”;护理评估：并行计算需求的“全身体检”;数据特征：“碎片化”与“重复性”的双重挑战;任务类型：“可拆分”与“依赖型”的混合体;资源现状：“小马拉大车”的现实困境;护理诊断：并行计算的“病症识别”;护理诊断：并行计算的“病症识别”;“单线程依赖症”;“内存饥饿症”;“I/O拥堵症”;“任务调度混乱症”;护理目标与措施：并行计算的“精准治疗”;护理目标与措施：并行计算的“精准治疗”;硬件“强基”：搭建并行计算集群;软件“通络”：部署并行计算工具链;流程“重构”：建立自动化分析管线;效果验证：效率提升超12倍;并发症的观察及护理：并行计算的“风险防控”;并发症的观察及护理：并行计算的“风险防控”;“节点罢工”：部分计算节点意外宕机;“数据打架”：多节点同时写入同一文件;“算力浪费”：任务分配不均;健康教育：培养“会用算力”的环境基因组学人才;健康教育：培养“会用算力”的环境基因组学人才;基础培训：理解并行计算原理;实操训练：掌握常用工具;思维转变：从“数据生产者”到“数据管理者”;总结;总结;总结;谢谢