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泛基因组图存储格式测试试题库及答案

单项选择题（每题2分，共10题）

1.以下哪种是常见的泛基因组图存储格式？

A.DOCXB.GFAC.JPEGD.MP4

2.泛基因组图存储主要目的是？

A.方便数据传输B.好看C.存储和管理基因组数据D.打印

3.GFA格式中节点用什么标识？

A.%B.C.@D.

4.以下对泛基因组图存储描述正确的是？

A.只存基因序列B.不包含结构信息C.包含多种生物学信息D.只用于动物

5.哪种格式适合大规模泛基因组数据存储？

A.CSVB.JSONC.FASTAD.BAM

6.泛基因组图存储数据时会涉及？

A.声音信息B.图像信息C.基因位置信息D.气味信息

7.一个完整泛基因组图存储格式不包含？

A.序列B.注释C.颜色信息D.连接关系

8.存储格式中记录边信息主要用于？

A.展示美观B.记录基因关联C.数据加密D.压缩数据

9.以下不属于存储格式考量因素的是？

A.可读性B.计算速度C.纸张大小D.扩展性

10.常用泛基因组图存储格式基于？

A.二进制B.文本C.音频D.视频

多项选择题（每题2分，共10题）

1.以下属于泛基因组图存储格式的有？

A.GFAB.VCFC.SAMD.BED

2.泛基因组图存储格式特点包括？

A.可扩展性B.不可读性C.灵活性D.唯一性

3.存储格式需要考虑的因素有？

A.数据量大小B.数据更新频率C.存储成本D.数据安全性

4.关于GFA格式正确的是？

A.有节点表示B.有边表示C.用于存储序列D.只能存植物数据

5.与泛基因组图存储相关的格式有？

A.FASTAB.FASTQC.BAMD.GTF

6.良好的泛基因组图存储格式应具备？

A.高效存储B.便于检索C.随意修改D.跨平台兼容

7.存储格式中包含的信息可能有？

A.基因变异B.序列长度C.染色体位置D.作者信息

8.以下能用于泛基因组图存储优化的方法有？

A.数据压缩B.索引构建C.数据加密D.随机排序

9.不同生物的泛基因组图存储格式区别在于？

A.数据量B.基因特征C.颜色模式D.注释方式

10.选择泛基因组图存储格式时要考虑？

A.研究目的B.数据分析工具C.团队技术水平D.数据来源

判断题（每题2分，共10题）

1.所有泛基因组图都用同一种存储格式。（）

2.GFA格式只能存储简单的泛基因组图。（）

3.存储格式对泛基因组数据分析影响不大。（）

4.泛基因组图存储不需要考虑兼容性。（）

5.一个好的存储格式应能快速读写数据。（）

6.存储格式中不能包含注释信息。（）

7.不同物种泛基因组图存储格式完全一样。（）

8.数据压缩能优化泛基因组图存储。（）

9.存储格式的可读性不重要。（）

10.只要数据能存进去，存储格式就没问题。（）

简答题（每题5分，共4题）

1.简述泛基因组图存储格式的重要性。

答：重要性在于能有效存储和管理海量基因组数据，便于后续分析、共享和比较，为基因组学研究提供基础支持，不同格式适用于不同场景，能提高研究效率。

2.列举两种常见泛基因组图存储格式及特点。

答：GFA格式，有节点和边表示，可清晰记录基因组结构和连接关系；VCF格式，主要用于存储基因变异信息，格式规范，便于不同软件处理。

3.选择泛基因组图存储格式时需考虑哪些因素？

答：要考虑数据量大小，大数据量需高效格式；数据更新频率，更新频繁要易扩展格式；存储成本，合理选择节省开支；数据分析工具兼容性，确保能被有效处理。

4.泛基因组图存储格式如何影响数据检索？

答：良好格式有清晰结构和索引机制，利于快速定位和提取所需数据，如按基因位置、变异类型等检索；差的格式结构混乱，检索效率低甚至无法精准检索。

讨论题（每题5分，共4题）

1.随着数据量增长，泛基因组图存储格式面临哪些挑战及应对策略？

答：挑战有存储容量不足、读写速度慢等。策略是研发更高效压缩算法减少数据量，优化存储结构提高读写速度，采用分布式存储提高扩展性，同时确保数据安全和兼容性。

2.不同研究领域对泛基因组图存储格式的需求有何差异？

答：医学领域注重变异信息存储和疾病关联分析，需格式能精准记录