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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种测序技术常用于检测基因结构变异(如倒位、重复)?
A.一代Sanger测序
B.二代外显子组测序(WES)
C.三代单分子实时测序(SMRT)
D.纳米孔测序(Nanopore)
答案:C
解析:三代测序(如SMRT)因长读长(10-100kb)特性,能跨越重复序列和复杂结构区域,更有效检测结构变异;A选项Sanger测序读长仅1kb,难以覆盖大段结构变异;B选项WES主要覆盖外显子区域,对内含子或大段结构变异敏感性低;D选项Nanopore虽为长读长,但SMRT是更典型的结构变异检测技术。
根据ACMG变异分类标准,以下哪项属于“致病性变异(Pathogenic)”的支持证据?
A.变异在人群数据库中的频率>1%
B.多个计算预测工具提示“有害”
C.家系共分离分析显示变异与表型共分离(LOD≥2)
D.功能实验证实变异导致蛋白功能完全丧失
答案:D
解析:ACMG标准中,致病性变异的“强证据(PVS1)”包括功能完全丧失(如无义、移码);A选项人群频率高属于排除致病性的证据(BA1);B选项计算预测为支持证据(PP3);C选项共分离为中等证据(PM2)。
基因数据解读中,常用的公共变异数据库不包括:
A.dbSNP
B.gnomAD
C.ClinVar
D.UniProt
答案:D
解析:UniProt是蛋白质序列和功能数据库,不直接存储基因变异数据;A(短变异数据库)、B(人群变异频率数据库)、C(临床意义变异数据库)均为基因数据解读核心数据库。
生信分析流程中,“比对(Mapping)”步骤的主要目的是:
A.去除测序接头和低质量reads
B.将测序reads定位到参考基因组
C.检测单核苷酸变异(SNV)
D.评估测序覆盖度和均匀性
答案:B
解析:比对是将测序reads与参考基因组序列匹配,确定其在基因组中的位置;A是质控(Trimming)步骤;C是变异检测(VariantCalling)步骤;D是覆盖度分析步骤。
连锁分析(LinkageAnalysis)主要用于:
A.确定肿瘤体细胞突变的克隆起源
B.定位孟德尔遗传病的致病基因区域
C.评估药物基因组学中的变异频率
D.分析基因表达数据的差异表达基因
答案:B
解析:连锁分析通过家系中标记位点与疾病表型的共分离,定位致病基因所在染色体区域;A是克隆进化分析;C是群体遗传学分析;D是转录组数据分析。
以下哪个工具常用于基因功能注释?
A.GATK
B.ANNOVAR
C.BWA
D.Samtools
答案:B
解析:ANNOVAR是经典的变异注释工具,可注释基因功能、人群频率、计算预测等信息;A(GATK)用于变异检测;C(BWA)用于比对;D(Samtools)用于处理SAM/BAM文件。
基因检测伦理规范中,“非预期发现(IncidentalFindings)”的处理原则不包括:
A.提前与受检者沟通是否接受非预期结果
B.仅报告与检测目的直接相关的变异
C.对严重可干预疾病的非预期变异应告知
D.对儿童检测避免报告成年-onset疾病变异
答案:B
解析:伦理规范要求需提前告知受检者是否接受非预期发现(如BRCA1变异在非癌症检测中发现),对严重可干预疾病需报告,儿童检测需避免成年疾病报告;B选项“仅报告直接相关”不符合伦理要求,可能遗漏重要健康信息。
外显子组测序(WES)的主要局限性是:
A.无法检测拷贝数变异(CNV)
B.难以覆盖高度重复的外显子区域
C.无法分析基因表达水平
D.测序成本显著高于全基因组测序(WGS)
答案:B
解析:WES通过探针捕获外显子,对高GC或高重复的外显子区域(如HLA基因)捕获效率低,导致覆盖不全;A错误,WES可通过覆盖度分析间接检测CNV;C是RNA-seq的功能;D错误,WES成本低于WGS。
检测拷贝数变异(CNV)的金标准技术是:
A.核型分析(Karyotyping)
B.荧光原位杂交(FISH)
C.芯片比较基因组杂交(aCGH)
D.定量PCR(qPCR)
答案:C
解析:aCGH可全基因组检测CNV,分辨率(50-100kb)高于核型分析(5-10Mb),是临床CNV检测的金标准;A用于染色体数目/大结构异常;B用于特定区域验证;D用于单个位点定量。
孟德尔遗传病基因解读中,“新发突变(DenovoMutation)”的确认需满足:
A.变异在父母中均未检测到
B.变异为错义突变
C.变异在人群数据库中频率>0.1%
D.家系中仅患者携带变异
答案:A
解析:新发突变指父母生殖细胞或早期胚胎发育中产生的突变,需通过父母样本验证
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