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基因组学考题试卷及答案
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、选择题(每题2分,共20分)
1.下列哪项不是高通量测序(NGS)技术的核心优势?
A.数据产量巨大
B.覆盖深度高
C.成本效益显著提升
D.读长普遍很长且固定
E.分析流程相对简单
2.在基因组测序中,Sanger测序法与二代测序法最根本的区别在于:
A.是否需要构建测序文库
B.读取序列的长度
C.是否依赖PCR扩增
D.获得序列的方式(串行vs并行)
E.费用的高低
3.以下哪个术语描述的是基因组中一个特定的核苷酸位置(或一小段序列)?
A.基因组大小
B.外显子
C.基因座
D.单倍型
E.等位基因
4.BLAST算法的主要目的是?
A.构建基因组物理图谱
B.计算基因组的GC含量
C.在已知序列数据库中寻找与输入序列相似的序列
D.预测基因编码区域
E.测序反应的实际执行
5.SNP(单核苷酸多态性)在基因组研究中主要价值在于:
A.构建基因家族
B.导致严重的遗传疾病
C.作为遗传标记进行基因分型、关联分析等
D.定义染色体编号
E.影响基因表达水平
6.RNA-Seq技术主要用于研究:
A.基因组中重复序列的分布
B.DNA序列的变异
C.特定基因的转录本丰度变化
D.蛋白的翻译后修饰
E.基因组的拷贝数变异
7.基于比较基因组学的分析,可以用来研究:
A.染色体核型
B.基因功能
C.物种间的亲缘关系和进化历程
D.基因表达调控网络
E.蛋白的结构预测
8.以下哪种变异类型通常涉及插入或删除的碱基数量不是1个或3的倍数,可能导致移码突变?
A.SNP
B.indel(插入缺失)
C.CNV(拷贝数变异)
D.基因重排
E.插入序列(IS)插入
9.限制性性内切酶识别和切割DNA的特定序列,这个特定序列通常被称为:
A.密码子
B.反密码子
C.回文序列
D.调控元件
E.外显子
10.基因组百科(GenomeEncyclopedia)的主要目的是:
A.提供基因组测序服务
B.收集、整理和发布已测序物种的基因组数据及注释信息
C.开发基因组分析软件
D.进行基因组功能的实验验证
E.预测基因组中的所有基因
二、填空题(每空1分,共10分)
1.基因组是指一个生物体所含的______的总和。
2.第二代测序技术(NGS)主要包括Illumina测序、IonTorrent测序和______等技术平台。
3.序列比对是基因组学数据分析中的基础步骤,常用的算法有______和Needleman-Wunsch算法。
4.SNP是基因组中发生频率较高的______变异。
5.RNA-Seq数据分析的主要目标是计算基因转录本在不同条件或组织中的______。
6.k-mer是进行基因组组装或序列比对时常用的概念,指的是从序列中提取的长度为k的______。
7.基因组拷贝数变异(CNV)是指基因组中特定DNA片段的______数量发生改变。
8.克隆是插入到载体(如质粒)中并进行扩增的______DNA片段。
9.基因组学在医学领域的应用包括疾病______、药物______和个体化医疗等。
10.生物信息学是利用计算机工具和统计学方法来获取、存储、分析和解释______数据的学科。
三、名词解释(每题3分,共15分)
1.基因组测序(GenomeSequencing)
2.基因组组装(GenomeAssembly)
3.基因表达谱(GeneExpressionProfile)
4.变异组学(VariationGenomics)
5.基因组编辑(GenomeEditing)
四、简答题(每题5分,共20分)
1.简述Sanger测序技术的原理及其主要特点。
2.简述二代测序(NGS)技术相比Sanger测序的主要优势。
3.简述什么是SNP?举例说明SNP是如何用于疾病关联研究的。
4.简述进行基因组序列比对的主要目的和基本流程。
五、论述题(每题10分,共20分)
1.论
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