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林木基因组重测序变异注释试题库及答案
一、单项选择题(每题2分,共10题)
1.林木基因组重测序主要是对()进行测序
A.全基因组B.部分基因C.线粒体D.叶绿体
2.变异注释中常用的数据库是()
A.NCBIB.BLASTC.dbSNPD.OMIM
3.以下哪种变异类型属于SNP()
A.缺失B.插入C.单碱基替换D.倒位
4.林木基因组重测序数据质量评估指标不包括()
A.测序深度B.覆盖度C.基因表达量D.碱基质量
5.进行变异检测常用的软件是()
A.SamtoolsB.RC.PythonD.Excel
6.变异注释的目的不包括()
A.发现新基因B.确定变异位置C.了解变异功能D.提高测序效率
7.以下哪种是常见的基因组重测序文库类型()
A.质粒文库B.BAC文库C.全基因组文库D.cDNA文库
8.林木基因组重测序分析流程顺序正确的是()
A.数据比对-变异检测-变异注释B.变异检测-数据比对-变异注释
C.变异注释-数据比对-变异检测D.数据比对-变异注释-变异检测
9.关于变异频率的说法正确的是()
A.只在群体水平有意义B.个体中不存在变异频率
C.与测序深度无关D.可反映变异在样本中的比例
10.以下不属于结构变异的是()
A.拷贝数变异B.易位C.点突变D.重复
答案:1.A2.C3.C4.C5.A6.D7.C8.A9.D10.C
二、多项选择题(每题2分,共10题)
1.林木基因组重测序的应用领域有()
A.遗传育种B.进化研究C.基因功能解析D.物种分类
2.变异注释需要的信息有()
A.变异位点B.参考基因组C.样本信息D.测序平台
3.常用的变异检测算法有()
A.基于比对的方法B.基于机器学习的方法C.基于统计的方法D.基于克隆的方法
4.结构变异包括()
A.缺失B.插入C.倒位D.易位
5.影响变异注释准确性的因素有()
A.参考基因组质量B.测序技术误差C.变异数据库完整性D.分析软件参数设置
6.基因组重测序数据处理步骤包括()
A.数据清洗B.序列比对C.变异检测D.结果可视化
7.以下关于SNP说法正确的是()
A.广泛存在于基因组中B.可影响基因表达C.是主要的遗传变异类型D.都具有功能
8.重测序文库构建过程涉及()
A.DNA提取B.片段化C.连接接头D.扩增
9.变异注释结果可呈现的形式有()
A.表格B.图形C.文本报告D.数据库
10.利用基因组重测序可研究林木的()
A.亲缘关系B.杂种优势C.抗病机制D.生长发育调控
答案:1.ABC2.ABC3.ABC4.ABCD5.ABCD6.ABCD7.ABC8.ABCD9.ABCD10.ABCD
三、判断题(每题2分,共10题)
1.林木基因组重测序只能用二代测序技术。()
2.变异注释就是确定变异的位置。()
3.所有的变异都对生物体有显著影响。()
4.测序深度越高,变异检测越准确。()
5.参考基因组不需要更新。()
6.软件检测出的变异一定是真实存在的。()
7.拷贝数变异属于SNP的一种。()
8.变异注释结果可以直接用于育种实践。()
9.不同的林木物种基因组重测序流程不同。()
10.全基因组重测序可以检测到所有类型的变异。()
答案:1.×2.×3.×4.√5.×6.×7.×8.×9.×10.×
四、简答题(每题5分,共4题)
1.简述林木基因组重测序的意义
可挖掘遗传变异,为遗传育种提供依据;助力进化研究,了解物种进化历程;解析基因功能,推动基础研究发展。
2.说明变异注释在林木研究中的作用
明确变异位置、类型及功能,有助于研究林木遗传机制、发现关键基因,为遗传改良和分子育种等提供信息。
3.列举变异检测的主要流程
先进行数据比对将测序数据与参考基因组比对,再用合适软件检测变异,最后对
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