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林木Hi-C染色质构象捕获试题库及答案

一、单项选择题（每题2分，共10题）

1.Hi-C技术主要用于研究（）

A.DNA序列B.染色质空间结构C.基因表达D.蛋白质相互作用

2.以下哪种酶常用于Hi-C实验中消化染色质（）

A.限制性内切酶B.蛋白酶C.淀粉酶D.脂肪酶

3.Hi-C实验中连接反应的作用是（）

A.连接断裂的DNAB.连接不同片段的染色质C.连接蛋白质D.连接引物

4.构建Hi-C文库时，需要进行（）

A.PCR扩增B.凝胶电泳C.离心D.透析

5.分析Hi-C数据常用的软件是（）

A.PhotoshopB.HiC-ProC.WordD.Excel

6.Hi-C技术能检测到的染色质相互作用距离范围是（）

A.几kb到MbB.几nm到μmC.几cm到mD.几?到nm

7.以下关于Hi-C的说法错误的是（）

A.可以揭示染色质三维结构B.只能用于动物研究C.需要高通量测序D.能发现新的调控元件

8.进行Hi-C实验，细胞样本要求（）

A.死细胞B.活细胞C.组织块D.细胞碎片

9.Hi-C数据可视化常用的工具是（）

A.IGVB.R语言C.PythonD.SPSS

10.若要研究林木特定染色体区域的染色质相互作用，优先选择（）

A.Hi-CB.RNA-seqC.ChIP-seqD.GWAS

二、多项选择题（每题2分，共10题）

1.Hi-C技术的应用领域包括（）

A.基因调控研究B.疾病机制探索C.物种进化分析D.林木育种

2.以下属于Hi-C实验步骤的有（）

A.细胞固定B.染色质消化C.连接反应D.文库构建

3.在Hi-C数据处理中，需要进行的操作有（）

A.数据过滤B.比对C.归一化D.聚类分析

4.影响Hi-C实验结果的因素有（）

A.实验样本质量B.酶的活性C.测序深度D.数据分析方法

5.与传统染色质研究技术相比，Hi-C的优势在于（）

A.全基因组范围B.高分辨率C.可定量分析D.操作简单

6.用于Hi-C实验的细胞类型可以是（）

A.植物分生组织细胞B.动物体细胞C.微生物细胞D.生殖细胞

7.构建Hi-C文库时用到的材料有（）

A.引物B.连接酶C.载体D.缓冲液

8.分析Hi-C数据可以得到的信息有（）

A.染色质环结构B.拓扑相关结构域C.基因与调控元件距离D.基因表达水平

9.Hi-C技术与其他技术联合使用可以（）

A.更深入解析调控网络B.验证实验结果C.发现新的生物学现象D.提高实验效率

10.以下关于Hi-C实验注意事项正确的是（）

A.防止核酸酶污染B.控制反应温度C.样本量要足够D.实验过程要无菌

三、判断题（每题2分，共10题）

1.Hi-C技术只能研究染色质的远距离相互作用。（）

2.构建Hi-C文库不需要考虑文库质量。（）

3.不同物种的Hi-C实验流程完全相同。（）

4.Hi-C数据的分辨率只取决于测序深度。（）

5.可以通过Hi-C技术直接观察到染色质的空间构象。（）

6.组织样本可以直接用于Hi-C实验。（）

7.数据分析时Hi-C数据不需要进行质量评估。（）

8.Hi-C实验中固定细胞的目的是保持染色质结构。（）

9.只要实验操作规范，Hi-C实验不会出现假阳性结果。（）

10.Hi-C技术在林木基因功能研究中没有应用价值。（）

四、简答题（每题5分，共4题）

1.简述Hi-C技术的基本原理。

答案：先用甲醛固定细胞使染色质交联，再用限制性内切酶消化染色质，然后进行连接反应使交联的染色质片段相互连接，构建文库测序，通过分析测序数据来推断染色质的空间相互作用和三维结构。

2.列举Hi-C实验中可能出现的问题及解决方法。

答案：问题如样本质量差，应选优质样本；酶活性低，要保证酶的质量和合适反应条件；测序数据质量低，需做好数据过滤和质量评估等。

3.说明Hi-C数据归一化的目的。

答案：消除不同样本间由于测序深度、实验操