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林木甲基化测序WGBS试题库及答案

一、单项选择题（每题2分，共10题）

1.WGBS主要检测的甲基化类型是（）

A.m5CB.m6AC.hm5CD.m4C

2.进行WGBS测序前，DNA样本需要进行（）处理

A.酶切B.超声打断C.磷酸化D.乙酰化

3.WGBS文库构建中常用的接头是（）

A.单端接头B.双端接头C.环状接头D.粘性接头

4.以下哪种软件可用于WGBS数据分析（）

A.BLASTB.BowtieC.TopHatD.Samtools

5.林木WGBS测序数据比对的参考基因组通常是（）

A.人类基因组B.拟南芥基因组C.该林木自身基因组D.水稻基因组

6.WGBS能检测到的甲基化位点是（）

A.随机位点B.CpG位点C.非CpG位点D.以上都对

7.高质量的WGBS测序数据Q30要求达到（）以上

A.50%B.60%C.70%D.80%

8.以下哪项不是WGBS的优点（）

A.全基因组覆盖B.分辨率高C.成本低D.可准确检测甲基化水平

9.在林木WGBS研究中，常选择（）作为对照样本

A.不同品种林木B.处理后的林木C.正常生长的林木D.转基因林木

10.WGBS数据中，用于表示甲基化水平的指标是（）

A.覆盖度B.深度C.甲基化率D.比对率

二、多项选择题（每题2分，共10题）

1.WGBS文库构建过程包括以下哪些步骤（）

A.DNA片段化B.末端修复C.加A尾D.连接接头

2.影响WGBS测序结果准确性的因素有（）

A.样本质量B.测序深度C.比对算法D.文库构建质量

3.用于WGBS数据分析的工具包括（）

A.BismarkB.MethylKitC.BedToolsD.FastQC

4.在林木WGBS研究中，可能的研究方向有（）

A.生长发育调控B.逆境响应C.品种进化D.基因功能验证

5.以下哪些属于甲基化修饰的生物学功能（）

A.基因表达调控B.维持基因组稳定性C.参与细胞分化D.影响蛋白质结构

6.WGBS测序平台有（）

A.IlluminaB.PacBioC.NanoporeD.454

7.构建WGBS文库时，对DNA样本的要求有（）

A.纯度高B.完整性好C.无降解D.一定的浓度

8.分析WGBS数据时，可进行的分析内容有（）

A.甲基化位点鉴定B.差异甲基化区域分析C.基因甲基化水平分析D.甲基化模式分析

9.在林木中，甲基化水平可能受到（）影响

A.环境因素B.激素水平C.发育阶段D.遗传背景

10.与其他甲基化检测技术相比，WGBS的优势在于（）

A.单碱基分辨率B.全基因组覆盖C.可检测多种甲基化类型D.操作简单

三、判断题（每题2分，共10题）

1.WGBS只能检测CpG岛的甲基化。（）

2.测序深度越高，WGBS数据越准确。（）

3.构建WGBS文库不需要进行PCR扩增。（）

4.所有林木的基因组都适合作为WGBS的参考基因组。（）

5.甲基化水平的改变一定会导致基因表达变化。（）

6.WGBS数据分析中不需要进行质量控制。（）

7.不同发育阶段的林木，其甲基化模式相同。（）

8.处理后的林木样本WGBS数据与对照一定有差异。（）

9.检测WGBS文库质量时只需要看文库大小。（）

10.WGBS可以检测到基因组中所有的甲基化位点。（）

四、简答题（每题5分，共4题）

1.简述WGBS的基本原理。

答：先对DNA进行亚硫酸氢盐处理，将未甲基化的C转化为U，而甲基化的C保持不变，再进行PCR扩增、文库构建与测序，通过与参考基因组比对分析，确定甲基化位点及水平。

2.说明WGBS文库构建的关键步骤。

答：关键步骤有DNA超声打断成合适片段，进行末端修复、加A尾，连接测序接头，最后进行PCR扩增富集文库片段。

3.列举两种常用的WGBS数据分析软件及功能。

答：Bismark用于将测序reads比对到参考基因组并