孟德尔随机化法分析胃癌与足跟骨密度间的因果关系及作用机制.pdfVIP

齐齐哈尔医学院学报２０２４年第４５卷第２２期ＪｏｕｒｎａｌｏｆＱｉｑｉｈａｒＭｅｄｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ２０２４ꎬＶｏｌ.４５ꎬＮｏ.２２２１０１

论著

孟德尔随机化法分析胃癌与足跟骨密度间的因果

关系及作用机制

许芳熙黄乐韵唐梅文

【摘要】目的通过两样本孟德尔随机化方法ꎬ探讨胃癌(ＧＣ)和足跟骨密度(Ｈｅｅｌｂｏｎｅｍｉｎｅｒａｌ

ｄｅｎｓｉｔｙ)之间的因果关系和作用机制ꎮ方法从全基因组关联研究(ＧＷＡＳ)中获取足跟骨密度和胃癌的

数据ꎬ采用Ｒ软件４.２.１版、方差反加权(ＩｎｖｅｒｓｅｖａｒｉａｎｃｅｗｅｉｇｈｔｉｎｇꎬＩＶＷ)和加权中位数等方法进行ꎬ用Ｒ

软件环境中的“ＴｗｏＳａｍｐｌｅＭＲ”包(０.５.７版)提供评估、测试和进行因果效应敏感性分析ꎮ与骨密度和胃癌

相关的数据集来自基因表达综合(ＧＥＯ)数据库ꎮ通过ｌｉｍｍａ软件包筛选差异表达基因(ｄｅｇ)ꎮ使用

ＣｌｕｓｔｅｒＰｒｏｆｉｌｅｒ和ＧＯｐｌｏｔ软件包进行富集分析ꎬ以验证ＭＲ分析的结果ꎮ结果ＭＲ数据分析提示了足跟

骨密度与胃癌存在因果关系ꎬ通过生物信息学分析了足跟骨密度和胃癌的遗传学机制ꎬ提示其可促进胃癌

的发生和发展ꎬ并为以后预防胃癌提供科学依据ꎮ结论足跟骨密度与胃癌之间存在因果关系ꎮ

【关键词】胃癌ꎻ足跟骨密度ꎻ孟德尔随机化ꎻ生物信息学

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[中图分类号]Ｒ６８１.８[文献标识码]ＡＤＯＩ:１０.３９６９/ｊ.ｉｓｓｎ.１００２１２５６.２０２４.２２.００１

Ｍｅｎｄｅｌｉａｎｒａｎｄｏｍｉｚａｔｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓｏｆｈｅｅｌｂｏｎｅｍｉｎｅｒａｌｄｅｎｓｉｔｙａｎｄｇａｓｔｒｉｃｃａｎｃｅｒａｎｄａｎａｌｙｓｉｓｏｆｒｅｌａｔｅｄ

ｇｅｎｅｓＸｕＦａｎｇｘｉꎬＨｕａｎｇＬｅｙｕｎꎬＴａｎｇＭｅｉｗｅｎ.ＧｒａｄｕａｔｅＳｃｈｏｏｌꎬＧｕａｎｇｘｉＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＣｈｉｎｅｓｅＭｅｄｉｃｉｎｅꎬ

ＮａｎｎｉｎｇꎬＧｕａｎｇｘｉ５３００００ꎬＣｈｉｎａ(ＸｕＦａｎｇｘｉꎬＨｕａｎｇＬｅｙｕｎꎬＴａｎｇＭｅｉｗｅｎ)ꎻＴｈｅＦｉｒｓｔＡｆｆｉｌｉａｔｅｄＨｏｓｐｉｔａｌｏｆ

ＧｕａｎｇｘｉＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＣｈｉｎｅｓｅＭｅｄｉｃｉｎｅꎬＮａｎｎｉｎｇꎬＧｕａｎｇｘｉ５３００２３ꎬＣｈｉｎａ(ＴａｎｇＭｅｉｗｅｎ).

Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ:ＴａｎｇＭｅｉｗｅｎꎬＥｍａｉｌ:６４８９７９２０６＠ｑｑ.ｃｏｍ.

【Ａｂｓｔｒａｃｔ】ＯｂｊｅｃｔｉｖｅＴｏｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｔｈｅｃａｕｓａｌｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｂｅｔｗｅｅｎｇａｓｔｒｉｃｃａｎｃｅｒ(ＧＣ)ａｎｄｈｅｅｌｂｏｎｅ

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ｍｉｎｅｒａｌｄｅｎｓｉｔｙ(ＢＭＤ)ａｎｄｔｈｅｍｅｃｈａｎｉｓｍｏｆａｃｔｉｏｎｂｙｕｓｉｎｇｔｈｅｔｗｏｓａｍｐｌｅＭｅｎｄｅｌｉａｎｒａｎｄｏｍｉｚａｔｉｏｎｍｅｔｈｏｄ.

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ＭｅｔｈｏｄｓＤａｔａｏｎｈｅｅｌＢＭＤａｎｄｇａｓｔｒｉｃｃａｎｃｅｒｗｅｒｅｏｂｔａｉｎｅｄｆｒｏｍｇｅｎｏｍｅｗｉｄｅａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｓｔｕｄｉｅｓ(ＧＷＡＳ)

ｕｓｉｎｇＲｓｏｆｔｗａｒｅｖｅｒｓｉｏｎ４.２.１ꎬｉｎｖｅｒｓｅｖａｒｉａｎｃｅｗｅｉｇｈｔｉｎｇ(ＩＶＷ)ꎬａｎｄｗｅｉｇｈｔｅｄｍｅｄｉａｎｍｅｔｈｏｄｓ.Ｔｈｅ

ＴｗｏＳａｍｐｌｅＭＲｐａｃｋａｇｅ(ｖｅｒｓｉｏｎ０.５.７)ｉｎｔｈｅＲｓｏｆｔｗａｒｅｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｗａｓｕｓｅｄｆｏｒｅｖａｌｕａｔｉｏｎꎬｔｅｓｔｉｎｇꎬａｎｄ

ｃａｕｓａｌｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙａｎａｌｙｓｉｓ.Ｄａｔａｓｅｔ