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2023年郑州大学《生物信息学》练习试卷2

一、名词解释

1、生物信息学

答案：生物分子信息的获取、存贮、分析和利用;以数学为基础，应用计算机技术，研究生

物学数据的科学。

2、相似性(similarity)

答案：相似性是指序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相同DNA碱基或氨

基酸残基顺序所占比例的高低。

3、同源性(homology)

答案：生物进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系。

4、BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)

答案：基本局部比对搜索工具，用于相似性搜索的工具，对需要进行检索的序列与数据库

中的每个序列做相似性比较。

5、HMM隐马尔可夫模型

答案：是蛋白质结构域家族序列的一种严格的统计模型，包括序列的匹配，插入和缺失状

态，并根据每种状态的概率分布和状态间的相互转换来生成蛋白质序列。

6、一级数据库

答案：一级数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注

释(投稿文章首先要将核苷酸序列或蛋白质序列提交到相应的数据库中)

7、二级数据库

答案：对原始生物分子数据进行整理、分类的结果，是在一级数据库、实验数据和理论分

析的基础上针对特定的应用目标而建立的。

8、GenBank

答案：是具有目录和生物学注释的核酸序列综合公共数据库，由NCBI构建和维护。

9、EMBL

答案：EMBL实验室：欧洲分子生物学实验室。EMBL数据库：是非盈利性学术组织

EMBL建立的综合性数据库，EMBL核酸数据库是欧洲最重要的核酸序列数据库，它定期

地与美国的GenBank、日本的DDBJ数据库中的数据进行交换，并同步更新。

10、DDBJ

答案：日本核酸序列数据库，是亚洲唯一的核酸序列数据库。

11、Entrez

答案：是由NCBI主持的一个数据库检索系统，它包括核酸，蛋白以及Medline文摘数

据库，在这三个数据库中建立了非常完善联系。

12、SRS(sequenceretrievalsystem)

答案：序列查询系统，是EBI提供多数据库查询工具之一。有与Entrez类似功能，

还提供一系列的序列分析工具，可以直接进行在线序列分析处理。

13、EST

答案：收大量cDAN或EST序列以及其他相关信息，目前最大的公共表达序列数据库。

14、GSS

答案：GeneBank数据库的一部分，收基因组DNA克隆的测序序列。

15、GEO

答案：基因表达精选是一个储存高通量功能基因组学数据的数据库。