2023年郑州大学《生物信息学》练习试卷3.pdfVIP

2023年郑州大学《生物信息学》练习试卷3

一、名词解释

1、SCOP数据库

答案：提供关于已知结构的蛋白质之间结构和进化关系的详细描述，包括蛋白质结构数

库PDB中的所有条目。17、PROSITE答案：是蛋白质家族和结构域数据库，包含具有生

物学意义的位点、模式、可帮助识别蛋白质家族的统计特征。

2、RefSeq

答案：是一个收录注释过的非冗余转录本、蛋白质和基因组序列的数据库。

3、结构域Structuredomain

答案：结构域，是在蛋白质三级结构中介于二级和三级结构之间的可以明显区分但又相对

独立的折叠单元。

4、开放阅读框ORF

答案：开放阅读框，位于DNA或RNA上起始密码子与终止密码子之间的序列。

5、启动子Promoter

答案：启动子是基因的一个组成部分，是位于结构基因5‘端上游区的DNA序列，控制

基因表达(转录)的起始时间和表达的程度。

6、3’UTR

答案：3’非翻译区的缩写，真核生物的转录终止信号是在3’非翻译区的答案：

polyA。

7、CpGisland

答案：是在哺乳动物基因组中的一个500bp到300bp的区域，富含GC。

8、模体Motif

答案：又称模体，蛋白质序列中短的保守区域，它们是结构域中保守性很高的部分。

9、PDB(ProteinDataBank)

答案：蛋白质结构数据库，是国际上著名的生物大分子结构数据库，由美国Brookhaven

国家实验室建立。

10、打分矩阵(scoringmatrix)

答案：在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。包括基于理论(如考虑核酸和氨基

酸之间的类似性)和实际进化距离(如PAM)两类方法。

11、遗传连锁图

答案：又叫遗传图谱(geneticmap)是以具有遗传多态性的遗传标记为“路标”，以遗传学距

离为图距的基因组图。

12、蛋白质组(proteom)

答案：是指一个基因组、一种生物或一个细胞/组织的基因组所表达的全套蛋白质。

13、基因组学

答案：研究生物基因组和如何利用基因的一门学问。

14、比较基因组学

答案：是在基因组图谱和测序的基础上，利用某个基因组研究获得的信息推测其他原核生

物、真核生物类群中的基因数目、位置、功能、表达机制和物种进化的学科。