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基因测序数据处理协议

鉴于双方（以下简称“委托方”和“处理方”）在平等、自愿、公平和诚实信用的基础上，就基因测序数据的处理与分析服务事宜达成一致，订立本协议，以资共同遵守。

第一条定义与解释

除非本协议另有明确约定，下列术语具有以下含义：

1.1“基因测序数据”是指通过基因测序技术产生的原始数据及其衍生数据，包括但不限于测序读长、质量分数、基因组变异信息等。

1.2“原始数据”是指由委托方提供，未经处理方任何分析或注释的基因测序原始数据。

1.3“处理结果”是指处理方根据本协议约定，对委托方提供的基因测序数据进行分析处理后产生的结果，包括但不限于分析报告、变异列表、注释文件、可视化图表等。

1.4“分析报告”是指处理方提供的详细说明数据处理过程、分析方法和结果的书面或电子文档。

1.5“保密信息”是指一方（披露方）以书面、口头、电子或其他形式向另一方（接收方）披露的，尚未公开的，与披露方商业活动、技术信息、基因测序数据等相关的，接收方知悉或应知悉的非公开信息。

1.6“知识产权”是指专利权、商标权、著作权（包括邻接权）、商业秘密、技术秘密及其他一切知识产权或权利。

1.7“不可抗力”是指不能预见、不能避免并不能克服的客观情况，包括但不限于自然灾害、战争、政府行为、流行病疫情等。

第二条服务内容与范围

2.1委托方委托处理方处理其提供的基因测序原始数据，处理方同意按照本协议约定提供数据处理与分析服务。

2.2具体服务内容包括：

2.2.1对委托方提供的基因测序原始数据进行质量控制和预处理，确保数据符合后续分析要求。

2.2.2根据委托方指定的分析类型或标准流程，进行基因变异检测，包括但不限于单核苷酸多态性（SNP）、插入缺失（Indel）、拷贝数变异（CNV）等的识别与注释。

2.2.3对检测到的变异进行生物学功能注释，预测其可能的影响，并提供相关注释信息。

2.2.4根据委托方需求，进行其他特定的分析，例如基因组组装、宏基因组分析、表达谱分析、通路富集分析等。

2.2.5撰写分析报告，详细说明数据处理流程、分析方法、结果解读和结论建议。

2.3处理方应按照约定的分析类型和标准，使用其合法获得的软件、工具和数据库完成数据处理和分析工作。

2.4处理结果以分析报告为主要形式，可能辅以符合行业标准的基因数据文件（如VCF,BAM,FASTA,GTF等格式）。

第三条双方权利与义务

3.1委托方的权利与义务：

3.1.1有权要求处理方按照本协议约定提供合格的数据处理与分析服务。

3.1.2有义务在约定的时间内向处理方提供完整、准确、合法的基因测序原始数据及相关必要信息，并保证其对提供的数据拥有合法的使用权或处置权。

3.1.3有义务按照本协议约定向处理方支付服务费用。

3.1.4有义务配合处理方就服务相关事宜进行必要的沟通与确认。

3.2处理方的权利与义务：

3.2.1有权按照本协议约定收取服务费用。

3.2.2有义务按照本协议第二条约定的服务内容、标准和要求，使用专业的技术和设备对委托方提供的基因测序数据进行处理和分析。

3.2.3有义务确保数据处理和分析过程符合国家及地方关于数据安全、生物伦理、个人信息保护的法律法规要求。

3.2.4有义务在约定的时间内将符合约定格式的处理结果（分析报告及可能的数据文件）交付给委托方。

3.2.5有义务对在服务过程中接触到的委托方基因测序数据及商业信息承担保密义务。

3.2.6有义务按照委托方的要求，对分析报告进行必要的解释和说明。

第四条知识产权

4.1委托方保留对其提供的基因测序原始数据的所有知识产权。

4.2处理方使用的通用分析软件、工具和数据库的知识产权归其respective权利人所有。处理方不得侵犯任何第三方的知识产权。

4.3分析报告中体现的处理方独特分析思路、方法、算法、模型或产生的独创性数据成果，其知识产权归属由双方根据贡献大小另行协商确定，并在本协议补充条款中明确约定；如无约定，视为属于处理方所有。处理方根据本协议约定向委托方交付的处理结果，委托方获得在协议约定范围内的使用许可，具体许可方式（如仅限内部研究使用）由双方约定。

4.4本协议不授予委托方处理方为提供本协议项下服务而专门开发或准备的软件、工具或代码的任何权利，除非双方另有书面约定。

第五条保密义务

5.1双方应对从对方获取的保密信息承担保密义务，未经对方书面同意，不得向任何第三方披露、泄露或使用该等保密信息，但法律法规另有规定或有权机关要求披露的除外。

5.2本保密义务不因本协议的终止而失效，持续有效期限为本协议