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大豆根中响应早期共生固氮的转录组分析.pdf

土壤与作物2025年3月第14卷第1期

SoilsandCrops,Mar.2025,14(1)：95−107

DOI：10.11689/sc.2024052101CSTR:32179.14.sc.2024052101

黄慧超，王佳龙，于春静，等.大豆根中响应早期共生固氮的转录组分析[J].土壤与作物，2025，14(1)：95−107.

HUANGHC，WANGJL，YUCJ，etal.Transcriptomeanalysisofsoybeanrootsinresponsetoearlysymbioticnitrogenfixation[J].Soils

andCrops，2025，14(1)：95−107.

大豆根中响应早期共生固氮的转录组分析

黄慧超，王佳龙，于春静，潘钰，赵晓宇，周舒扬

（黑龙江省科学院微生物研究所,黑龙江哈尔滨150010）

摘要：为挖掘大豆根中响应早期共生固氮过程中的关键基因，并探究这些关键基因的功能和代谢途径，本研究利用转录

组学技术对不接种根瘤菌与接种根瘤菌1d后的大豆根系材料进行RNA测序，通过对差异表达基因进行GO富集和

KEGG富集分析来挖掘参与早期共生固氮过程中的关键基因，进一步筛选受根瘤菌调控的转录因子，再对其中富集数量最

多的AP2/ERF家族成员进行进化分析，最后通过qRT-PCR验证其中部分基因的表达情况。研究共鉴定出824个响应根瘤

菌侵染的差异表达基因（DEG），GO富集和KEGG富集分析结果表明，DEG主要富集在转录调控、激素相关以及次生代

谢产物合成等通路上。进化分析结果，表明大豆中AP2/ERF家族成员可根据与MtERN1/2和LjERN亲缘关系的远近聚为三

个分支，其中第Ⅰ分支可能在诱导根瘤菌侵染和根瘤器官发生中发挥作用。qRT-PCR结果表明，AP2/ERF转录因子在接种

根瘤菌后确实受到不同程度地调控。本研究中发现的DEG为更好地理解早期共生固氮机制提供了候选分子。

关键词：大豆；共生固氮；转录组；AP2/ERF转录因子

中图分类号：S565.1文献标识码：A

Transcriptomeanalysisofsoybeanrootsinresponsetoearlysymbioticnitrogenfixation

HUANGHuichao，WANGJialong，YUChunjing，PANYu，ZHAOXiaoyu，ZHOUShuyang

（InstituteofMicrobiology,HeilongjiangAcademyofSciences,Harbin150010,China）

Abstract：Inordertoexplorethekeygenesinresponsetoearlysymbioticnitrogenfixationinsoybeanrootsaswellasthe

functionsandmetabolicpathwaysofthesekeygenes,thisstudyusedtranscriptomicstechnologytoperformRNAsequencingon

soybeanrootmaterialsonedayafterwithorwithoutinoculationofrhizobia.Thekeygenesinvolvedintheearlysymbioticnitrogen

fixationprocesswereexploredbyGOenrichmentandKEGGenrichmentanalysisofdifferentiallyexpressedgenes,andthe