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《单分子基因测序第2部分：测序仪性能评价》标准发展研究报告

EnglishTitle:DevelopmentResearchReportontheStandardofSingle-MoleculeGeneSequencing—Part2:PerformanceEvaluationofSequencingInstruments

摘要

本报告旨在系统阐述《单分子基因测序第2部分：测序仪性能评价》标准制定的背景、目的、核心内容及其对行业发展的战略意义。基因测序技术历经第一代Sanger测序、第二代高通量测序（NGS）的演进，现已进入以单分子、长读长为特征的第三代测序（TGS）时代。以纳米孔测序技术为代表的单分子测序，因其长读长、实时、无需扩增等优势，在基因组学研究和临床精准医疗领域展现出巨大潜力。然而，当前该领域，特别是国内，缺乏统一、科学的仪器性能评价标准，导致产品性能评估不一，技术迭代与市场应用受限，且存在被国外技术垄断的风险。

本报告详细分析了该标准立项的必要性，指出其旨在填补国内单分子基因测序仪性能评价标准的空白，规范评价方法，为仪器研发、生产、质检、采购及临床应用提供权威、客观的技术依据。标准的核心技术内容明确了适用范围，规定了基于单分子实时荧光测序法、单分子纳米孔链测序法及标签测序法的测序仪在准确性、读长、通量、速度等关键性能指标的评价要求与试验方法。该标准的制定得到了国家级科研专项的支撑，是推动我国生物技术（BT）与信息技术（IT）融合创新、实现高端生命科学仪器自主可控的关键举措。报告结论认为，该标准的发布与实施将有力促进我国单分子测序技术的规范化、产业化发展，提升行业整体技术水平与国际竞争力，为精准医疗和生命科学研究提供坚实的技术保障。

关键词：

单分子基因测序；第三代测序；纳米孔测序；性能评价；标准化；精准医疗；生物技术

Single-moleculegenesequencing;Third-generationsequencing;Nanoporesequencing;Performanceevaluation;Standardization;Precisionmedicine;Biotechnology

正文

一、标准立项的背景与目的意义

基因测序技术自20世纪70年代诞生以来，经历了深刻的变革。第一代Sanger测序法以其超过99.99%的极高准确性和约1000bp的读长，至今仍是基因检测的国际金标准。进入21世纪，以高通量、低成本为核心特征的第二代测序技术（NGS）迅猛发展，以Illumina、LifeTechnologies及中国的华大智造等公司为代表，已将单个人类全基因组测序成本降至百美元级别。NGS技术凭借其高通量优势，已深度融入感染性疾病防控、遗传病诊断、肿瘤筛查、产前检测等临床领域，占据了主要的市场份额。

然而，NGS技术在服务于个体化精准医疗的终极目标时，仍面临若干根本性技术挑战：其一，读长普遍较短（通常低于600bp），不利于复杂基因组区域的拼接、结构变异检测和单倍型定相；其二，测序流程耗时较长，从样本制备到数据产出通常需要数天，难以满足某些急性感染或重症的快速诊断需求；其三，依赖于聚合酶链式反应（PCR）扩增以增强信号，此过程不仅丢失了DNA碱基修饰（如表观遗传学）信息，还可能引入扩增偏差和错误；其四，依赖复杂的光学、机械和电子系统，导致仪器成本高昂，维护复杂。

以单分子、长读长、实时测序为核心特征的第三代测序技术（TGS），被视为突破上述瓶颈最具前景的发展方向。根据信号探测原理，单分子测序主要分为基于光信号（如PacificBiosciences的SMRT技术）和基于电信号（如OxfordNanoporeTechnologies的纳米孔测序技术）两大路径。其中，英国OxfordNanoporeTechnologies（ONT）公司推出的纳米孔测序仪，不仅继承了长读长（平均读长超过10kbp）的优势，更在测序速度、设备便携性和成本上展现出显著竞争力，其测序准确率已逼近NGS水平，在病原体快速检测、宏基因组学、全长转录组分析等领域备受瞩目。

目前，全球纳米孔测序市场几乎由ONT公司主导，形成了技术垄断。尽管国内如齐碳科技等创新企业通过持续研发，已成功推出具有自主知识产权的纳米孔测序仪，实现了从“0”到“1”的突破，但行业整体发展仍面临一个关键制约：相关标准体系的缺失。缺乏统一、权威的性能评价标准，导致国产仪器在性能验证、横向对比、市场准入和用户认可度方面面临障碍，无法进行科学、公平的“同台竞技”，严重延缓了我国在该前沿领域的产业化进程和技术迭代速度。

因此，制定《单分子基因测序第2部分：测序仪性能评价》标准具