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- 2026-02-11 发布于江苏
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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种文件格式是基因变异检测结果的标准存储格式?
A.BAM(比对序列文件)
B.FASTQ(原始测序数据)
C.VCF(变异标注格式)
D.FASTA(核酸序列文件)
答案:C
解析:VCF(VariantCallFormat)是专门用于存储基因变异(如SNV、Indel)信息的标准格式,包含变异位置、参考等位基因、替代等位基因等核心信息;BAM是测序数据比对后的二进制文件,FASTQ是原始测序读长文件,FASTA是核酸序列存储文件,均不专门用于变异结果存储。
根据ACMG(美国医学遗传学与基因组学学会)指南,致病性变异的判定标准不包括以下哪项?
A.变异在健康人群数据库中的频率显著低于疾病发病率
B.多个计算工具预测变异具有破坏性
C.家系共分离分析显示变异与疾病表型共遗传
D.变异位于基因非编码区且无功能注释
答案:D
解析:ACMG指南强调致病性判定需结合人群频率、功能预测、家系共分离、已知致病突变同源性等证据;非编码区无功能注释的变异通常属于“意义未明(VUS)”,不满足致病性标准。
全外显子测序(WES)的主要优势是?
A.覆盖全基因组所有区域
B.聚焦编码区(约1-2%基因组),成本效益高
C.检测拷贝数变异(CNV)的分辨率高于WGS
D.无需进行原始数据质控
答案:B
解析:WES通过捕获外显子区域(约占基因组1-2%)实现高效测序,在遗传病诊断中因编码区变异占致病突变的85%以上而广泛应用;WGS覆盖全基因组,CNV检测分辨率WGS更高,所有测序数据均需质控。
以下哪个数据库主要用于存储人类基因变异的临床意义?
A.gnomAD(基因组聚集数据库)
B.dbSNP(单核苷酸多态性数据库)
C.ClinVar(临床变异数据库)
D.ExAC(外显子组聚集数据库)
答案:C
解析:ClinVar由NCBI维护,专门收录变异与疾病关联的临床解读;gnomAD和ExAC主要提供健康人群变异频率,dbSNP记录所有已知SNP(无论是否致病)。
生信分析中,使用GATK进行变异检测时,关键步骤“碱基质量分数重校准(BQSR)”的主要目的是?
A.提高测序读长与参考基因组的比对效率
B.修正测序过程中因化学错误导致的碱基质量分数偏差
C.去除重复测序片段(PCRduplicates)
D.合并多个样本的变异检测结果
答案:B
解析:BQSR通过已知变异位点(如dbSNP)校正测序仪原始碱基质量分数,减少因测序化学错误导致的假阳性变异;比对效率由BWA等工具优化,去重复用Picard,合并结果用GATKCombineVariants。
以下哪种变异类型最可能导致基因功能完全丧失?
A.同义突变(Silentmutation)
B.错义突变(Missensemutation)
C.无义突变(Nonsensemutation)
D.内含子剪接位点附近1bp变异
答案:C
解析:无义突变会提前产生终止密码子,导致截断蛋白,通常引发无义介导的mRNA降解(NMD),功能完全丧失;同义突变不改变氨基酸,错义突变可能部分影响功能,剪接位点变异可能影响但非绝对。
肿瘤基因检测中,“驱动突变(Drivermutation)”与“乘客突变(Passengermutation)”的核心区别是?
A.驱动突变频率更高
B.驱动突变直接促进肿瘤发生发展
C.乘客突变仅存在于肿瘤组织
D.驱动突变无法通过靶向治疗干预
答案:B
解析:驱动突变是肿瘤发生的关键因素(如EGFRL858R驱动肺癌),乘客突变是肿瘤演化中的随机突变,无功能影响;驱动突变频率未必更高(如某些低频致癌突变),正常组织可能存在乘客突变(如胚系变异),部分驱动突变可被靶向药抑制。
基因数据解读中,“外显率(Penetrance)”指的是?
A.携带致病变异的个体表现出疾病表型的比例
B.变异在人群中的发生频率
C.基因在不同组织中的表达水平
D.测序数据中目标区域的覆盖比例
答案:A
解析:外显率是携带致病变异的个体实际表现出疾病的概率(如BRCA1突变携带者终身乳腺癌风险约60%,即外显率60%);人群频率是等位基因频率(MAF),表达水平是基因表达量,覆盖比例是测序覆盖度。
以下哪种工具常用于基因变异的功能注释?
A.BWA(比对工具)
B.ANNOVAR(注释工具)
C.GATK(变异检测工具)
D.Samtools(序列处理工具)
答案:B
解析:ANNOVAR可注释变异的基因组位置、功能影响(如外显子/内含子)、人群频率(gnomAD)、计算预测(SIFT/PolyPhen)等;BWA用于比对,GATK用于
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