冷水微生物群落季节性变化及检测方法分析.pdfVIP

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Fig.5eSeasonalvariationofrelativeabundancesofthephylotypesobtainedfromcoldwater.

Thecoloursarecorrespondingtothemajorphylogeneticgroups.Phylotypesareseparatedby

solidlines.Arrowsindicatephasetransitionsoftheclusteranalysisoftherespectivefingerprints.

Bluebarsatthex-axisindicatemonthswithhighprecipitation.(a)Phylotypesfromthe-

basedSSCPfingerprints.(b)PhylotypesfromtheRNA-basedSSCPfingerprints.(For

interpretationofthereferencestocolourinthisfigurelegend,thereaderisreferredtotheweb

versionofthisarticle.)

drinkingwaterreservoirsthelowcontentofribosomeshasbeendescribedasaresultoftheir

smallsize,resultinginalowerdetectionratealsobyothermoleculardetectionmethodslikeFISH

(Nielsenetal.,2006;Leeetal.,2009).

3.6.热饮用水群落的分类组成我们在热饮用水

群落中检测到了总共19种细菌系统型。12

在基于的分析中发现了12种系统型，在基于RNA的分析中发现了13种系统型，其中有6种系统型

在这两种类型的分析中都出现。

（表

1）。最常见的六种系统型具有最高的丰度，占55%的或 3%的RNA（表2）。尽

管通过比较聚类分析，热饮用水图谱按季节分配了一个群落模式，但在系统型丰度的动

力学中未观察到明确的季节性阶段（图6）。热水群落的特征是五个主要的分类群，即

aproteobacteria、Acidobacteria、Alphaproteobacteria、Bacteroidetes和

nctomycetes（表2）。每个分类群都由一个单一的系统型主导，其丰度没有显示出显

著的季节性变化。和RNA基础的图谱显示了类似的趋势。

表2主要分类群及其在热水中的优势种群，通过和RNA图谱揭示。相对丰度值

为所有样本的平均值。用D标记的种群仅出现在图谱中，用R标记的仅出现在

RNA图谱中，而用DR标记的则同时出现在两者中。粗体显示的种群也在本研究或以

前的研究中的冷水样本中出现（“Cxx”和“Hxx”分别表示本研究中冷水（Cxx）和热

水（Hxx）的种群特征，“PT(E)xx”表示2003年由Eichler等人检测到的种群）。用星

号标记的种群根据其系统发育关系被认为是嗜热的（详情见表3）。