基于全基因组关联分析挖掘小麦籽粒硬度指数和沉淀值的显著性位点.pdfVIP

江苏农业学报(ＪｉａｎｇｓｕＪ.ｏｆＡｇｒ.Ｓｃｉ.)ꎬ２０２５ꎬ４１(１１):２０８８￣２０９６

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江伟ꎬ张晓ꎬ赵仁慧ꎬ等.基于全基因组关联分析挖掘小麦籽粒硬度指数和沉淀值的显著性位点[Ｊ].江苏农业学报ꎬ２０２５ꎬ

４１(１１):２０８８￣２０９６.

ｄｏｉ:１０.３９６９/ｊ.ｉｓｓｎ.１０００￣４４４０.２０２５.１１.００２

基于全基因组关联分析挖掘小麦籽粒硬度指数和

沉淀值的显著性位点

１ꎬ２２２２２１２２

江伟ꎬ张晓ꎬ赵仁慧ꎬ李曼ꎬ吴旭江ꎬ李韬ꎬ胡文静ꎬ高德荣

(１.扬州大学农学院ꎬ江苏扬州２２５００７ꎻ２.江苏里下河地区农业科学研究所/农业农村部长江中下游小麦生物学与遗传育种

重点实验室ꎬ江苏扬州２２５００７)

摘要:为解析小麦品质指标籽粒硬度指数(ＧＨ)与沉淀值(ＳＶ)的遗传基础ꎬ本研究利用扬麦１６和扬麦２２杂

交获得Ｆ、扬麦２０和镇麦１６８杂交获得Ｆꎬ再将２个单交组合的Ｆ进行杂交产生四亲本杂交种ꎬ然后自交衍生获

１１１

得３２０份稳定株系并将其作为试验材料ꎮ利用小麦１５ＫＳＮＰ芯片数据ꎬ结合３年共４个环境的ＧＨ与ＳＶ表型数

据ꎬ采用混合线性模型(ＭＬＭ)进行全基因组关联分析ꎮ结果表明ꎬＧＨ表型分布呈现１∶１且在不同环境间具有显

著相关性ꎬＳＶ表型符合正态分布且在不同环境间具有显著相关性ꎮ本研究共检测到８个与ＧＨ显著关联的位点ꎬ

其中有４个位点为多环境稳定位点ꎬ分布在染色体５Ｄ(３个位点)和５Ａ(１个位点)上ꎬ可解释５.８０％~１３４０％的表

型变异ꎻ检测到２０个与ＳＶ显著关联的位点ꎬ其中３个位于染色体５Ｄ上的位点为多环境稳定位点ꎬ可解释４.７８％~

７４６％的表型变异ꎻ染色体５Ｄ上的ＡＸ￣１０９９８６９３９、ＡＸ￣１１１４６４１６４和ＡＸ￣１１０４７６３３２位点同时与ＧＨ和ＳＶ显著关联ꎬ

为一因多效稳定位点ꎮ进一步分析发现ꎬＡＸ￣１０９９８６９３９、ＡＸ￣１１１４６４１６４和ＡＸ￣１１０４７６３３２对ＧＨ和ＳＶ均具有极显著

效应(Ｐ００１)ꎮ在染色体５Ａ上的位点ＡＸ￣１１０４１９８３４增效等位变异可使ＧＨ值提高２４４４％(Ｐ００１)ꎮ

关键词:小麦ꎻ硬度指数ꎻ沉淀值ꎻ全基因组关联分析

中图分类号:Ｓ５１２.１文献标识码:Ａ文章编号:１０００￣４４４０(２０２５)１１￣２０８８￣０９

Ｄｉｓｃｏｖｅｒｉｎｇｏｆｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｓｉｔｅｓｆｏｒｗｈｅａｔｇｒａｉｎｈａｒｄｎｅｓｓａｎｄｓｅｄｉｍｅｎｔａｔｉｏｎ

ｖａｌｕｅｕｓｉｎｇｇｅｎｏｍｅ￣ｗｉｄｅａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｓｔｕｄｙ

１ꎬ２２２２２１２

ＪＩＡＮＧＷｅｉꎬＺＨＡＮＧＸｉａｏꎬＺＨＡＯＲｅｎｈｕｉꎬＬＩＭａｎꎬＷＵＸｕｊｉａｎｇꎬＬＩＴａｏꎬＨＵＷｅｎｊｉｎｇꎬ

ＧＡＯＤｅｒｏｎｇ２

(１.ＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＣｏｌｌｅｇｅｏｆＹａｎｇｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＹａｎｇｚｈｏｕ２２５００７ꎬＣｈｉｎａꎻ２.ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓｏｆｔｈｅＬｉｘｉａｈｅＤｉｓｔｒｉｃｔｉｎＪｉａｎｇｓｕＰｒｏｖｉｎｃｅ/

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