耐盐碱粗根茎莎草高通量测序及生物学信息分析.pdfVIP

2023年第23期现代园艺试验研究

耐盐碱粗根茎莎草高通量测序及生物学信息分析

111111,2*

苗小荣，唐柳茹，黎东海，张小艳，王慧茹，牛俊奇

（1玉林师范学院生物与制药学院，广西玉林537000；2玉林师范学院广西高校亚热带生物资源保护与利用

重点试验室，广西玉林537000

要：粗根茎莎草是海岸沙丘生态系统的重要组成部分。为了解析自然生长条件下粗根茎莎草基因表达情况，采用高通量测序

技术，对海滨自然生长的粗根茎莎草的根、茎和叶混合样品进行转录组测序分析。结果显示，粗根茎莎草一共获得高通量测序数据

8.44Gb，Q30大于92.45%；获得27276个Unigene基因，平均长度为1103.12bp，N50长度1763bp，GC含量44