天南星科植物叶绿体基因组结构特征及系统发育分析：以天南星等20个物种为例.pdfVIP

第43卷第1期中国野生植物资源Vol.43No.1

2024年1月ChineseWildPlantResourcesJan.2024

doi：10.3969/j.issn.1006-9690.2024.01.005

天南星科植物叶绿体基因组结构特征及系统发育分析：以天

南星等20个物种为例

许祎珂，寇佩雯，刘长乐，李爽，孙晓春，黄文静*

（陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/秦药特色资源研究开发国家重点实验室（培育），

陕西咸阳712083）

摘要目的：天南星科植物资源丰富、分布广泛。研究天南星科植物叶绿体基因组特征，为天南星科的系统发育

及进化研究提供依据。方法：本研究以GenBank数据库中获得的20条该科植物叶绿体全基因组序列为基础数据，

利用REPuter、MISA、mVISTA和MAFFT等软件分析其重复序列、基因组差异、IR边界和系统发育等特征。结果：

天南星科植物叶绿体基因组长度介于158521~175906bp之间，共编码129~139个基因。在20个该科物种中，均

检测出50条重复序列，正向重复和反向重复为主要类型，并鉴定出253~482个SSR位点，单核苷酸和二核苷酸重

复居多。序列全局比对表明其非编码区的差异较大，并发现accD、ycf2和ycf1三个高度可变区。共线性分析可知，

基因组序列同源性较高，只有一个物种发现重排或倒位现象。IR边界分析表明天南星科植物有一定保守性。所筛

选的SSR位点和高度可变区可用于遗传多样性分析、物种鉴定和DNA条形码等。结论：本研究明确了天南星科物

种的系统发育关系，为天南星科物种进化和遗传多样性研究提供了一定的科学依据。

关键词天南星科；叶绿体基因组；SSR位点；遗传多样性；系统发育分析

中图分类号：R282.5文献标识码：A文章编号：1006-9690（2024）01-0042-09

StructuralCharacteristicsandPhylogeneticAnalysisofChloroplast

GenomesinAraceaePlants:Take20SpeciessuchasArisaema

heterophyllumforExample

XuYike，KouPeiwen，LiuChangle，LiShuang，SunXiaochun，HuangWenjing*

（StateKeyLab.ofResearchDevelopmentofCharacteristicQinMedicineResources（Cultivation）/

Co-constructionCollaborativeInnovationCenterforChineseMedicineResourcesIndustrializationby

ShaanxiEducationMinistry，ShaanxiUniversityofChineseMedicine，Xianyang712083，China）

AbstractObjective：Araceaeplantswererichinresourcesandwidelydistributed.Tostudythechloro‐

plastge