基于图神经网络的病毒和宿主关联预测研究.pdf

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摘要

原核病毒及其宿主是微生物生态系统的重要组成部分,他们之间的相互作用

对于生物学、医学和生态学等领域具有深远影响。深入研究原核病毒与其宿主之

间的相互作用机制,不仅有助于揭示病毒-宿主交互网络的内在规律,还能为细

菌感染的预测以及抗生素替代疗法的开发提供理论支持。随着宏基因组测序技术

的出现和计算生物学的发展,许多计算模型被提出用于病毒-宿主关联预测。然

而,现有病毒-宿主关联预测模型的属级预测精度仍然不高。为进一步提升病毒-

宿主关联预测精度,本研究针对现有模型存在的问题,提出三种关联预测模型:

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