实验三基因组序列分析2.ppt

实验三基因组序列分析第一页，共48页。

实验三基因组序列分析第二页，共48页。

原核生物基因结构1长开放阅读框2高基因密度3简单的基因结构4基因组中GC含量变化非常大特点：3第三页，共48页。

真核生物基因结构特点：1基因结构复杂2具有复杂的基因转录调控方式3具有丰富的可变剪接4有明显的CpG岛、密码子使用具有偏好性4第四页，共48页。

基因组序列分析5第五页，共48页。

例：WhatisGenePrediction?

GivenanuncharacterizedDNAsequence,findout:

1.Wheredoesthegenestartsandends?

2.Whichregionscodeforaprotein?

AGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCATCGAAGTTGCATGACGATGCATGACCTAGCAAGTTGCATGACGATTGACCTAGTGCATGACGATGCATGACCTAGCAGCAT