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蛋白质结构预测与分析试题及答案

1.同源蛋白结构预测的核心生物学基础是（）

A.蛋白质序列由核酸序列编码

B.蛋白质功能由结构决定

C.同源序列进化上亲缘关系近，三维结构保守性远高于序列保守性

D.蛋白质翻译后修饰不影响高级结构

参考答案：C

解析：A选项是中心法则核心内容，与同源建模的逻辑基础无直接关联；B选项是结构生物学的普遍共识，但并非同源建模方法成立的核心依据；C选项正确，同源建模的核心前提是序列同源性高于30%的蛋白通常具有高度相似的三维骨架，即使序列相似度降至20%左右，核心结构域的折叠模式仍大概率保持保守，结构保守性远高于一级序列的保守性；D选项错误，磷酸化、糖基化、泛素化等翻译后修饰会显著改变蛋白局部构象甚至整体折叠状态。

2.AlphaFold2能够实现高精度蛋白质单体结构预测，其核心引入的用于捕捉残基长程相互作用的模块是（）

A.循环神经网络（RNN）

B.多序列比对（MSA）模块

C.注意力机制（Transformer）

D.分子动力学模拟模块

参考答案：C

解析：A选项RNN多用于处理序列化特征，存在长程依赖衰减问题，无法有效捕捉序列中距离较远的残基间的相互作用；B选项MSA是AlphaFold2的核心输入特征来源，本身并非捕捉长程相互作用的功能模块；C选项正确，AlphaFold2搭载的Evoformer模块基于自注意力机制构建，可同时