基于网络药理学和转录组学探讨芥酸抗流感的作用机制.docx

基于网络药理学和转录组学探讨芥酸抗流感的作用机制

刘立福1，李晓渝1，颜佳琪1，柯嘉意1，高桃桃1，周颖璇1，邓小燕1,2，梁晓丽1,2*(1.广州医科大学金域检验学院，广州511436；2.广东省感染性疾病智能化诊断工程技术研究中心，广州511436)

摘要：目的联合转录组学与网络药理学探究芥酸抗流感的药理学机制。方法采用甲型流感H1N1病毒株感染A549细胞构建流感感染模型。模型构建成功后，使用Trizol试剂提取细胞总RNA进行转录组测序，得到芥酸抗流感的差异基因并进行趋势分析。进一步筛选出芥酸干预流感的回调基因进行GO功能及KEGG通路富集分析。通过CTD、PharmMapper、PRED、STP数据库预测芥酸作用靶点，并与回调基因取交集，获取芥酸作用靶点与回调基因的共同基因(即芥酸干预流感的核心基因)。在STRING平台上构建核心基因蛋白互作(protein-proteininteraction，PPI)网络并通过Cytoscape软件筛选出芥酸防治流感的关键核心基因。接着，使用分子对接和分子动力学模拟技术验证关键核心基因与芥酸的结合活性，基因集富集分析(genesetenrichmentanalysis，GSE