从基因组扫描到致病基因精确定位：连锁区域特征描述与缩小.pdfVIP

8从组

扫描到致病

精确定位组扫描所涉及的位点

伊恩・C・格雷

ParadigmTherapeutics(S)PteLtd,新加坡

8.1引言

使用家系样本进行复杂性状的连锁分析通常会产生多个宽泛且定义不清的连

锁峰，这些峰代表了数百万个碱基对的（例如，Grettarsdottir等，

2002年）；在每个峰的范围内，可能存在与所研究疾病相关的（或基

因）。上，简单的串联重复标记（STRs）已被用于全组连锁扫描

（见第8.2.3节）；然而，STR标记组合正逐渐被单核苷酸多态性（SNP）

标记集取代，后者具有许多优势，包括更高的标记密度和易于使用（

Evans和Cardon，2004年）。假设已经使用SNPs、STRs或两者的组合完

成了初步的连锁分析，本章的目标是通过基于人群的方法研究者完成连

锁区域的特征描述和缩小过程，最终目的是识别候选并直接测试它们与

所研究疾病性状的关联。这通常是通过对感组区间（关键区间）

或

中的标记进试，比较病例组和对照组之间的等位频率