生物信息学;第三章
序列特征分析;第一节引言;一、基因结构;原核生物基因结构;原核基因的结构;操纵子模型结构;操纵子模型结构;真核生物基因结构;真核基因的结构;二、蛋白质结构;蛋白质的一级结构;蛋白质的二级结构;蛋白质空间结构;知道了基因密码,科学家们可以推演出组成某种蛋白质的氨基酸序列,却无法绘制蛋白质空间结构。因而,揭示人类每一种蛋白质的空间结构,已成为后基因组时代的制高点,这也是结构基因组学的基本任务。;蛋白质空间结构;对DNA序列和蛋白质序列进行序列特征分析,能够使我们从分子层次上了解基因的结构特点,了解与基因表达调控相关的信息,了解DNA序列与蛋白质序列之间的编码,了解蛋白质序列与蛋白质空间结构之间的关系和规律,为进一步研究了解蛋白质功能与蛋白质结构之间的关系提供理论依据。;第二节
DNA序列特征分析;分析DNA序列,除了进行序列比对之外,更重要的工作是从序列中找到基因及其表达调控信息。寻找基因的工作有两个:一是识别与基因相关的特殊序列信号,如启动子、起始密码子,通过信号识别大致确定基因所在的区域;二是预测基因的编码区域,或预测外显子所在的区域。在此基础上,结合两个方面的结果确定基因的位置和结构。绝大部分基因表达调控信息隐藏在基因序列的上游区域,在组成上具有一定的特征,可以通过序列分析识别这些特征。;一、DNA序列的基本信息;;GC含量是基因组的特征之一;
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