生物信息学算法赋能AI靶点预测.pptxVIP

生物信息学算法赋能AI靶点预测;目录;引言：生物信息学与AI融合驱动靶点预测新范式;;;PPT内容概览与目标;;;;;核心生物信息学算法基础;;;蛋白质互作网络揭示功能模块;;;赋能靶点预测的AI模型与方法;;;;1.RNN处理变长序列数据

RNN及其变体LSTM/GRU能捕捉序列中的长程依赖关系。适用于分析蛋白质序列或基因表达时间序列数据。

2.自注意力机制捕捉全局关系

Transformer中的自注意力机制允许序列中任意两个位置直接交互。能更好地理解蛋白质序列中远端残基间的功能关联。

3.预训练语言模型的迁移学习

像ESMFold等模型在大量蛋白质序列上预训练，学习通用表示。微调后可用于特定任务，如靶点预测，尤其在数据有限时优势明显。

;;;;;AI靶点预测的工作流程与实践案例;;;;;案例三：老药新用与药物重定位中的靶点预测;;挑战、局限性与未来展望;;1.模型可解释性不足的黑箱问题

复杂的深度学习模型预测过程难以理解。生物学家难以信任一个无法提供生物学机理解释的“黑箱”预测结果，阻碍其向临床转化。

2.过拟合与泛化能力担忧

在有限、有偏的数据上训练的复杂模型容易过拟合。模型在训练集上表现优异，但应用到新疾病、新物种时性能可能大幅下降。

3.对因果关系的推断能力有限

大多数模型基于相关性学习，只能预测关联，难以区分因果。将关联性靶点误判为因果性靶点，可能导致后续药物开发失败。