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狗尾草属与稻属MULEs结构特征及进化关系解析

一、引言

1.1研究背景

转座子作为基因组中的可移动遗传元件，在生物进化过程中扮演着极为重要的角色。其中，Mutator转座子自1981年被依阿华州立大学的Robertson教授在玉米中发现以来，因其具有转座活性高、诱变能力强等特点，迅速成为玉米功能基因研究的关键标记转座子。在其他植物中，Mutator的同类转座子存在不同程度的变异，被称为Mu同源因子或Mu类似因子（Mu-likeelements或Muanalogs，MULEs）。

MULEs广泛分布于众多植物基因组中，对植物基因组的结构、功能和进化有着深远的影响。它们能够插入到基因内部或附近区域，改变基因的表达模式，甚至导致基因突变，为植物的遗传多样性提供了丰富的素材。例如，在小麦和水稻的cDNA文库中发现了mudrA的同源序列，预示着这些物种中存在着活跃的Mu转座子系统。然而，目前仅在拟南芥的DDM1突变体和真菌的Fusariumoxysporum中发现了转座活跃的Mu同源因子，对于大多数植物中的MULEs而言，它们的存在状态、变异程度以及如何激活其转座活性，仍然是亟待深入探索的科学问题。

狗尾草属（Setaria）植物种类繁多，分布广泛，包含了重要的模式植物和经济作物。其中，狗尾草（Setariavirid