基于OTU号种水平物种分析方法探讨.pdfVIP

在进行物种信息注释时，大部分情况可注释到种水平的OTU比较少，在常规的分析中，

在某个水平未鉴定出物种信息的OTU我们会统计为unclassified，这种统计无疑将未鉴定到具

体物种信息的OTU进行笼统化，因此，我们增加一种种水平结合OTU的分析，具体分析流程

及方法如下：

1、没有注释到物种信息的OTU用OTU号标记

2、数据库中在种水平有比较多的信息为unidentified、uncultured_bacterium、

uncultured_organism、uncultured_archaeon、uncultured_eukaryote，不同序列标记这种物种

信息的其实属于不同的物种，泛泛的将这些物种信息汇总到一起，会存在偏差，注释

为这些物种信息的OTU后面也添加上对应的OTU号。

在进行上述两种情况的处理后，我们再对种水平结合OTU的数据进行汇总分析，包括

species.heatmap、种水平物种分布柱状图、种水平样品聚类树与柱状图组合分析图、种水平差

异性矩阵热图Bray-cutis.matrix.heatmap。