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生物信息学生物信息公司生物信息分析师实习生实习报告

一、摘要

2023年6月5日至2023年8月22日，我在一家生物信息公司担任生物信息分析师实习生，负责高通量测序数据处理与分析。期间，我参与处理了3个批次共计50GB的RNASeq数据集，使用R语言和Python脚本完成了数据质控、差异表达分析和功能注释，最终输出12份分析报告。通过实践掌握了STAR、Samtools、DESeq2等工具的参数优化流程，并总结出一套标准化的小样本测序数据快速分析模板，可缩短后续同类任务处理时间约30%。这些经验验证了课堂学习的生物信息学算法在真实场景中的可操作性，也为后续研究提供了方法论参考。

二、实习内容及过程

2023年6月5日到8月22日，我在一家生物信息公司实习，岗位是生物信息分析师。公司主要做基因测序数据的分析服务，客户有医院和科研机构。我的任务就是帮他们处理实验数据，出分析报告。

第12周主要是熟悉环境，学公司用的数据处理流程。比如怎么用STAR软件对RNASeq数据做比对，怎么用Samtools处理SAM文件，这些我之前都没用过，公司给的培训材料挺基础，我就自己上网找教程补课，花了3天时间把STAR和Samtools的参数调优搞明白。

第35周参与了一个肺癌相关的项目，处理的是3个批次totaling50GB的RNASeq数据。客户要的是差异表达基因列表和GO富集分析结果。我用了