分子模拟—第六章 长程作用力的计算.pptxVIP

长程作用力的计算分子模拟·第六章|从Ewald求和到快速多极子方法

Contents本章内容框架分子模拟—第六章长程作用力的计算01长程作用力概述与物理本质02长程力计算的核心挑战03Ewald求和方法04粒子网格Ewald方法（PME）05快速多极子方法（FMM）06反应场方法与其他替代方案07长程静电作用在生物分子模拟中的应用

Chapter01长程作用力概述与物理本质理解库仑力的衰减特性与分子体系中远程相互作用的支配地位

第六章·长程作用力长程作用力的定义与核心特征长程作用力是指势能随距离衰减缓慢（通常按1/r?，n≤2）的相互作用，其影响范围远超近邻粒子，在分子模拟中必须进行全局性处理而非简单截断，否则将引入系统性偏差。库仑势按1/r衰减，在数十埃距离上仍具有与热运动能kT相当的量级，不可被忽略或截断处理1/r偶极-偶极相互作用按1/r3衰减，虽比单极作用衰减更快，但在极性溶剂体系中仍构成显著的远程贡献1/r3伦敦色散力按1/r?衰减属于短程力，通常可在10–12?处安全截断，但长程色散校正仍需解析补偿源于瞬时偶极诱导的量子涨落效应，广泛存在于所有原子与分子之间10–12?条件收敛特性长程力的条件收敛使求和结果依赖于求和顺序，这是Ewald方法需要解决的根本数学问题通过周期性边界条件下的球壳求和或Ewald分裂技术实现绝