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基于图神经网络的药物遗传毒性预测结题报告

一、研究背景与问题提出

药物研发是一个高投入、高风险、长周期的复杂过程，其中药物安全性评价是决定药物能否成功上市的关键环节。遗传毒性作为药物安全性评价的重要组成部分，主要关注药物及其代谢产物对生物体遗传物质（如DNA）的损伤能力，这种损伤可能导致基因突变、染色体畸变等，进而引发癌症、遗传性疾病等严重后果。据统计，约有30%的药物在临床前研究阶段因遗传毒性问题被淘汰，这不仅造成了巨大的资源浪费，也严重影响了药物研发的进程。

传统的药物遗传毒性评价方法主要包括体内实验和体外实验。体内实验如小鼠微核试验、大鼠显性致死试验等，虽然能较为真实地反映药物在生物体内的遗传毒性，但存在实验周期长、成本高、动物使用量大等缺点。体外实验如细菌回复突变试验（Ames试验）、体外哺乳动物细胞染色体畸变试验等，具有操作相对简便、成本较低等优势，但往往难以完全模拟药物在生物体内的代谢过程和复杂的生理环境，导致评价结果的准确性和可靠性受到一定限制。

随着计算机技术和人工智能的快速发展，基于机器学习的药物毒性预测方法逐渐成为研究热点。早期的机器学习方法如支持向量机（SVM）、随机森林（RF）等，在药物遗传毒性预测方面取得了一定的成果。然而，这些方法大多将药物分子视为一维的特征向量，忽略了药物分子的三维结构信息以及原子之间的相互作用，难以准确捕捉药物分子的本质特征，从而限制