Bioconduc注释包功能与应用指南.pdfVIP

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Bioconductor:注释包概述

2020年4月27日

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概述

目前,annotate的基本目的是接口例程,以支持用户依赖

Bioconductor项目中不同元数据包的操作。当前annotate包含四大类功能函

数。

?用于从特定元数据库中提取数据的接口函数。

?支持查询国家医学馆(NLM)和国家生物技术(NCBI)提

供的不同网络服务的功能。

?支持组织和构建位置数据的函数,用于辅助geneplotter中的部分基

因绘图与查找例程。

?从列表生成HTML输出的函数,可超至不同网络。

简要描述这些不同方面的第二和第三部分,随后在本剩余部分

集中讨论第一类别。其他三类内容各有独立。

获取元数据有两种互补策略:一是使用经多源整合的高度人工校验数据,

二是依赖。前者通常时效性较低但更全

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