药物设计学第五章药物发现的虚拟筛选方法.pptVIP

第五章 药物发现的虚拟筛选方法第一节 概述先导物 候选药物 靶点大分子 化学生物学化学信息学 生物信息学虚拟筛选虚拟筛选:针对重要疾病特定靶标生物大分子的三维结构或定量构效关系(QSAR)模型，从现有小分子数据库中，搜寻与靶标生物大分子结合或符合QSAR模型的化合物，进行实验筛选研究。

虚拟筛选流程基于分子对接虚拟筛选流程

SARS爆发，从现有药物中快速筛选，老药，安全，直接进临床。SARS冠状病毒(SARS-CoV)蛋白水解酶(Mpro)的同源蛋白模拟结构；虚拟筛选现有药物库MDL/CMC(/products/knowledge/medicinal_chem/index.jsp)；老药肉桂硫胺（抗精神分裂和抗炎)：SARS-CoVMpro的抑制剂；

(A)肉桂硫胺的化学结构；(B)肉桂硫胺与SARS-CoVMpro活性位点的作用方式(绿线：-NH?或-CH?氢键相互作用；红线：-CH?O氢键相互作用；蓝线：C145的巯基(-SH)与肉桂硫胺的C=C双键作用酶水平抑制活性IC50为5.0μM，能抑制病毒颗粒的复制;细胞水平抑制SARS-CoV的活性为31μM;是冠状病毒Mpro的专一性抑制剂。

第二节 化学信息处理一、化学信息的表示方法1.一维结构表示SMILES编码的立体化学信息表示

第二节 化学信息处理一、化学信息的表示方法2.二维结构